Les défensines aviaires appartiennent à la grande famille des peptides antimicrobiens qui sont des composants clés de l’immunité innée des muqueuses [1]. Ces molécules peuvent être produites par les granulocytes et les cellules épithéliales [2]. Elles peuvent être purifiées à partir de la moelle osseuse du poulet et sont actives contre un panel de souches bactériennes Gram+ et Gram- [3]. L’expression des gènes des deux défensines aviaires majeures (AvBD1 et AvBD2) dans le tissu intestinal est corrélée à la résistance de l’hôte contre la colonisation des salmonelles [4]. Tandis que cette expression peut s’observer à la naissance, son évolution au cours des premières semaines de vie reste méconnue [5, 6]. De façon à évaluer l’influence de l’âge et du microbiote intestinal, nous avons comparé les profils d’expression de ces deux défensines dans le tissu intestinal de poussins axéniques ou conventionnels pendant les deux premières semaines postéclosion. La cinétique d’expression d’AvBD1 est apparue différente de celle d’AvBD2, indépendamment du statut microbiologique des poussins. Selon la localisation anatomique, le niveau d’expression d’AvBD1 est apparu modulé positivement dans l’ileum ou négativement dans le caecum par la présence du microbiote. La composition du microbiote étant connue comme différente entre ces deux parties de l’intestin, des travaux futurs utilisant des poussins monoxéniques pourraient permettre d’identifier les espèces bactériennes commensales influençant l’expression de ce peptide antimicrobien.