Introduction : Les acides gras polyinsaturés oméga-3 à longue chaîne (AGPIω3-LC) et l’acide docosahexaénoïque (DHA) en particulier, ont des propriétés athéro-protectrices reconnues mais les mécanismes d’action au niveau vasculaire ont été peu décrits. Dans ce contexte, le but de cette étude a été de déterminer l’impact du DHA sur l’expression globale des gènes (transcriptomique) et protéines (protéomique) au niveau aortique. Méthodes : Des souris athérosclérotiques LDLR-/- ont été nourries pendant 20 semaines avec un régime enrichi en saindoux (10%, p/p) et cholestérol (0,045%, p/p) et ont reçu, soit une huile de tournesol riche en acide oléique (Groupe Contrôle), soit un mélange d’huiles fournissant 2% des apports énergétiques sous forme de DHA (Groupe DHA). Résultats : L’apport en DHA a engendré, comme attendu, une réduction des concentrations plasmatiques en cholestérol (-28%, p<0,001) et triglycérides (-37%, p<0,01), de la pression artérielle systolique (-16 mmHg, p<0,01), ainsi qu’une diminution de l’étendue des lésions athérosclérotiques (-35%, p<0,001). Les résultats de l’étude protéomique ont mis en exergue l’impact du DHA sur les voies métaboliques avec une activation des métabolismes glucidique [augmentation de la glycolyse (ENO1 et 3, PKM) et de la voie des pentoses phosphates (G6PD)] et lipidique [augmentation de la b-oxydation (HADHA, ACADVL, PCCB)] ainsi qu’une stimulation des défenses anti-oxydantes (augmentation de SOD1 et HSP75). L’analyse transcriptomique a mis en évidence l’impact du DHA sur la composante inflammatoire. En effet, la majorité des fonctions et des voies de signalisation affectées par la supplémentation en DHA sont en relation avec l’activité des cellules immunitaires. Cette analyse a notamment révélé une réduction de l’expression de molécules d’adhésion (Selectin-P, ICAM-2, PCAM-1), de chimiokines et de leurs récepteurs (CCR7, CXCL12, CX3CL1, CCL-5,) ou de gènes appartenant au complexe majeur d’histocompatibilité (HLA-DRB1, HLA-DQB1, HLA-DQA1). De plus, l’analyse des régulateurs transcriptionnels a permis d’identifier PPARg, INFg et NFkB comme les facteurs de transcription les plus significativement modulés. Conclusion : L’analyse nutrigénomique que nous avons réalisé a permis l’identification des cibles moléculaires du DHA au niveau vasculaire contribuant à une meilleure compréhension des mécanismes d’action athéro-protectrice du DHA. La composante inflammatoire étant particulièrement affectée, les recherches futures viseront à étudier plus précisément l’impact du DHA et de ses métabolites oxygénés sur l’activité des cellules immunitaires