Gérer la santé animale consiste à prendre des décisions et mettre en œuvre des mesures afin de supprimer ou réduire les effets sanitaires et les conséquences socio-économiques des maladies. Les décisions sont prises à plusieurs échelles et correspondent en fait à un très large éventail de situations et problèmes. D’une part, elles sont prises par l’éleveur au niveau d’un atelier de production pour des maladies endémiques. D'autre part, pour lesmaladies épidémiques et/ou zoonotiques majeures, il est fréquent que les pouvoirs publics soient le gestionnaire du risque. Les approches de modélisation sont quasi-indispensables pour l'éclairage pertinent de toutes ces décisions. Les modèles épidémiologiques apportent des éléments qualitatifs non monétaires qui sont déjà utiles en la matière. L'intégration de leurs résultats ou leur couplage avec les modèles économiques permet de produire des éléments plus avancés en termes de coût-efficacité ou coût-bénéfice et ainsi de rationnaliser l'allocation de ressources, tant pour le décideur de type éleveur individuel que pour un gestionnaire collectif ou public. Les externalités issues des choix individuels de certains acteurs restent peu traitées