Biodiversité microbienne dans les cours d’eau du bassin de la Durance : conséquences de la présence de bactéries phytopathogènes dans les biofilms
Résumé
Des études récentes ont révélé que l’écologie de la bactérie phytopathogène « Pseudomonas syringae » est étroitement liée au cycle de l’eau douce. Cette bactérie qui peut provoquer des maladies chez un grand nombre de plantes cultivées peut être isolée dans la neige, les eaux de pluie et de ruissellement, dans les torrents, les rivières, les lacs de rétention, sur les plantes sauvages et même dans les nuages. Elle est présente dans les biofilms récoltés dans les cours d’eau et des tuyaux de systèmes d’irrigation. Nous nous intéressons à la diversité de ces populations bactériennes dans les cours d’eau et les biofilms du bassin de la Durance, depuis l’amont en dehors des zones de culture, jusqu’à l’aval en basse Durance où l’eau est utilisée pour l’irrigation des plantes cultivées. Nous posons la question du rôle de réservoir d’agents phytopathogènes que pourraient constituer ces biofilms et sur l’impact de l’usage et de la gestion de l’eau sur la dynamique de ces populations, en interactions biotiques avec d’autres organismes vivants, présents dans les biofilms
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