Les territoires de l’Intersalar, au Sud de l’Altiplano bolivien, sont emblématiques d’un système socio-écologique vulnérable où l’enjeu de durabilité est exacerbé par la fragilisation d’une agriculture paysanne parachutée dans le commerce mondial. La zone Intersalar constitue un espace convoité en dépit d’un milieu exigeant (froid, aridité, haute altitude, salinité, etc.). La forte augmentation des prix du quinoa et la mécanisation des pratiques agricoles, vécues comme des opportunités sans précédent par les agriculteurs aymaras, menacent l’équilibre fragile d’un système écologique et social aujourd’hui marqué par une crise de la fertilité (baisse de rendements, érosion des sols, exacerbation des conflits d’accès au foncier, etc.). La réduction significative de la complémentarité agriculture/élevage s’accompagne d’une individualisation et d’une monétarisation de certaines pratiques agricoles qui transforment les conditions du renouvellement de la fertilité. La capacité d’innovation dont font preuve les producteurs dans leurs modes de renouvellement de gestion individuelle et collective de la fertilité est donc au coeur des enjeux du maintien de l’activité agricole. Nous proposons une analyse critique du mouvement historique de la notion de fertilité, éminemment polysémique, pour ensuite en interroger le sens et les enjeux dans la zone Intersalar. Ce faisant nous proposons un regard renouvelé sur le concept de fertilité et montrons qu’il existe un fort hiatus entre les acceptions paysannes et le sens commun que lui confèrent les agronomes et les agents de développement. Ces résultats théoriques et empiriques invitent à de nouveaux paradigmes pour penser la fertilité et accompagner les agriculteurs aymaras de la zone Intersalar.