BRC4Env, un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections au service des dispositifs expérimentaux de longue durée - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Access content directly
Conference Poster Year : 2018

BRC4Env, un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections au service des dispositifs expérimentaux de longue durée

Céline Ratié
  • Function : Author
  • PersonId : 1204400
Philippe Berche
  • Function : Author
  • PersonId : 1206701
Jose-Luis Almeida Falcon
  • Function : Author
  • PersonId : 1206925
Nicolas Soler-Dominguez
  • Function : Author
  • PersonId : 1206926

Abstract

Le réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections « ressources environnementales », BRC4Env (https://www.brc4env.fr/, https://doi.org/10.15454/TRBJTB) a pour objectif de rassembler les ressources biologiques utiles aux recherches pour l’environnement agricole, notamment en accueillant les collections d’échantillons prélevés dans les dispositifs expérimentaux de longue durée. Ainsi, les ressources environnementales, biologiques et/ou génomiques sont échantillonnées à partir de sols, de sédiments, d’eaux, d’écosystèmes agricoles, et conservées dans des collections organisées. BRC4Env conserve et distribue les ressources (matériel biologique et données associées) de manière sécurisée et avec une traçabilité optimale. BRC4Env rend ces ressources disponibles pour les chercheurs du monde académique, mais aussi de l'industrie et de la société civile. Parmi les dispositifs de BRC4Env, deux d’entre eux sont spécifiquement dédiés aux sols. La plateforme GenoSol, créée en 2008, est un outil collectif de l'INRA qui fournit une infrastructure scientifique et technique pour permettre l’acquisition, la conservation et la caractérisation des ressources génétiques de sols provenant d’échantillonnages de grande envergure (Dequiedt et al., 2016). Elle s’articule autour de trois services i) Un Conservatoire de Ressources Génétiques (CRG) qui a pour but de stocker et mettre à disposition les ressources génétiques de sols ii) Un Laboratoire d’Analyses et de Développement Moléculaires (LADM) dans lesquels sont développées et réalisées des analyses moléculaires pour caractériser les ressources génétiques microbiennes des sols issus du CRG iii) Un Système d’Information Environnemental (SIE) qui analyse les données produites dans le LADM. La plateforme GenoSol est impliquée dans deux infrastructures de recherche, RARe-BRC4Env pour le CRG, et AnaEE-France (http://anaee-france.fr/) pour l'ensemble de la plateforme. La caractérisation moléculaire taxonomique des populations microbiennes des sols est un enjeu majeur pour permettre de mieux comprendre les impacts anthropique. La conservation des sols et de leurs ressources génétiques permettra de mieux comprendre les mécanismes en jeu et mettre en évidence les fonctions essentielles aux fonctions écosystémiques des sols agricoles. Le Conservatoire Européen d’Echantillons de Sols, CEES, constitue un outil collectif de l’Inra dont l’objectif principal est la conservation à long terme d’échantillons de sols (Ratié et al., 2010). Il a été mis en place en 2003 pour les échantillons de sols prélevés dans le cadre du Réseau de Mesures de la Qualité des Sols (RMQS). Ses activités se sont par la suite étendues d’une part, aux échantillons issus des programmes nationaux d’inventaire de sols et d’autre part, à des échantillons issus de programmes scientifiques de surveillance des sols, comme le projet européen Integrated Carbon Observation System (ICOS). Il y a un enjeu fort à conserver ces échantillons, pour i) disposer d’une banque d’échantillons géoréférencés et représentatifs des sols français et de leur variabilité, ii) permettre leur remobilisation afin de réaliser a posteriori des analyses et iii) évaluer certaines dérives analytiques. BRC4Env est un des piliers constitutifs de l'Infrastructure de recherche nationale « Ressources Agronomiques pour la recherche », RARe (https://www.agrobrc-rare.org/), co-portée par l’INRA, l’IRD et le CIRAD et le CNRS.
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18-Dispositifs-BRC4Env.pdf (1.49 Mo) Télécharger le fichier
Origin : Files produced by the author(s)

Dates and versions

hal-02786159 , version 1 (05-04-2023)

Identifiers

  • HAL Id : hal-02786159 , version 1
  • PRODINRA : 451740

Cite

Christian Mougin, Céline Faivre-Primot, Samuel Mondy, Céline Ratié, Philippe Berche, et al.. BRC4Env, un réseau de Centres de Ressources Biologiques et de collections au service des dispositifs expérimentaux de longue durée. « Enjeux sur le sol : les dispositifs de longue durée pour répondre aux questions d’aujourd’hui et de demain », Nov 2018, Versailles, France. , 2018. ⟨hal-02786159⟩
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