Les bases de données de séquençage : GEO, SRA, ENA, ArrayExpress
Résumé
De nos jours, lors de la publication de résultats, il est nécessaire de rendre public les éventuelles données de séquençage générées. Si un faible nombre d’irréductibles continuent à ne fournir les données que sur demande, les bonnes pratiques poussent à les déposer dans des bases de données librement accessibles. Quatre grandes bases de données de séquençage existent : les états-uniennes GEO et SRA du NCBI, et les européennes ArrayExpress et ENA de l'EMBL-EBI. Avant une petite visite rapide, précisons que ces bases de données sont gratuites tant pour le dépôt qu'en accès aux données disponibles, et qu'elles rendent donc un service très utile à la communauté scientifique.