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Article De Blog Scientifique Année : 2017

Les bases de données de séquençage : GEO, SRA, ENA, ArrayExpress

Résumé

De nos jours, lors de la publication de résultats, il est nécessaire de rendre public les éventuelles données de séquençage générées. Si un faible nombre d’irréductibles continuent à ne fournir les données que sur demande, les bonnes pratiques poussent à les déposer dans des bases de données librement accessibles. Quatre grandes bases de données de séquençage existent : les états-uniennes GEO et SRA du NCBI, et les européennes ArrayExpress et ENA de l'EMBL-EBI. Avant une petite visite rapide, précisons que ces bases de données sont gratuites tant pour le dépôt qu'en accès aux données disponibles, et qu'elles rendent donc un service très utile à la communauté scientifique.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02789866 , version 1 (05-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02789866 , version 1
  • PRODINRA : 421829

Citer

Guillaume Devailly. Les bases de données de séquençage : GEO, SRA, ENA, ArrayExpress. 2017. ⟨hal-02789866⟩
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