La propagation d’agents pathogènes dans une métapopulation dépend fortement de la structure du réseau de contacts entre les différentes populations. Nous nous intéressons ici au réseau orienté, pondéré et dynamique constitué par les mouvements commerciaux d’animaux entre troupeaux bovins en France. Les propriétés topologiques de ce réseau sont explorées. Le risque lié à la propagation d’agents pathogènes et les conséquences en termes épidémiologiques et économiques sont évalués par des expériences de percolation et par le ratio d’accessibilité du réseau, en prenant en compte l’évolution temporelle de ce réseau. Le risque épidémiologique est également évalué pour des maladies enzootiques bovines telles que la diarrhée virale bovine et la paratuberculose à l’aide d’une modélisation stochastique de la transmission de l’infection couplant les échelles intra- et inter-troupeaux