Dans le cadre de l'étude de la biodiversité de l'écosystème caecal, une première étape consiste à réaliser un inventaire moléculaire. Il s'agit à la fois d'obtenir une image des espèces associées à l'écosystème caecal « lapin », mais aussi de décrire la distribution au sein des grands groupes bactériens. Ce travail a déjà été réalisé chez d'autres espèces (porc, Leser et al., 2002; cheval, Daly et al. 2001). Chez le lapin, une seule étude avec un nombre limité de clones a été réalisée récemment (46 clones sur lapereaux âgés de 56 j, Abecia et al. 2005). L’objectif de notre étude est de compléter et d’enrichir l’inventaire moléculaire de l'écosystème caecal,chez le lapin adulte, en équilibre physiologique.