Alternaria dauci est un champignon nécrotrophe phytopathogène qui s'attaque à la carotte (Daucus carota). Jusqu'ici, aucun cas de résistance complète n'a été mis en évidence, mais certaines variétés, bien que sensibles à l'infection, sont capables de limiter le développement du champignon. De précédentes études ont pu mettre en évidence que les réactions de défense des plantes contre les agents phytopathogènes nécrotrophes impliquaient souvent la voie de l'acide jasmonique. Le travail présenté dans ce rapport intervient dans le cadre de l'étude des facteurs génétiques de la résistance de la carotte à A. dauci. Afin de mieux caractériser cette interaction, des portions de gènes de la voie de signalisation de l'acide jasmonique tels que COI1 et JAR1 ont été clonées. Des amorces dégénérées ont été conçues pour amplifier des fragments de ces gènes à partir des séquences protéiques de différentes espèces. Les réactions PCR effectuées avec ces amorces ont abouti au clonage partiel de JAR1 et de deux fragments identifiés comme homologues à COI1, mais différents entre eux. Une fois la séquence complète de ces gènes obtenue, ils seront utilisés dans un premier temps pour l'identification de polymorphismes de substitution (SNP) potentiellement liés à des loci de traits quantitatifs (QTL) liés à la résistance à A. dauci. Ces gènes seront également utilisés pour étudier leur niveau d'expression au cours de l'attaque fongique dans différents cultivars de carotte.