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Communication dans un congrès

Comparaison de différentes stratégies spatiales d'échantillonnage d'une core collection parmi des populations naturelles d'espèces fourragères

Résumé : Sept stratégies d’échantillonnage d’une core collection sont comparées sur deux collections de populations naturelles d’espèces fourragères (Lolium perenne et Medicago truncatula) préalablement évaluées pour des caractéristiques agronomiques. Les cinq premières stratégies consistent en des tirages aléatoires simples ou stratifiés selon un seul niveau de classification des populations: (i) aléatoire simple (stratégie Random); (ii) stratifié selon une classification basée sur les caractéristiques agronomiques (stratégie Stratagro); (iii) stratifié selon la région ou le pays d’origine (stratégie Stratreg); (iv) stratifié selon les caractéristiques agronomiques avec contrainte de contiguïté géographique (stratégie Straconti); (v) stratifié selon les structures spatiales des populations (stratégie Stratspa), déterminées par les méthodes de la géostatistique. Il s’agit de méthodes statistiques adaptées à l’analyse de données spatiales et à la mise en évidence de structure ou distributions spatiales non aléatoires. Enfin, deux autres stratégies déterministes sont testées; elles sont basées sur un critère de maximisation de distance entre populations, ce critère étant appliqué aux données agronomiques de base des populations (stratégie PCSS) et à leurs composantes spatiales (stratégie SPPCSS). Les différentes stratégies sont comparées selon deux critères: leur capacité à capturer la diversité phénotypique contenue dans la collection de départ, mesurée par un indice de Shannon, et leur aptitude à restituer la structuration spatiale de la collection globale, mesurée par une distance entre cartes établies pour des caractères agronomiques. Les comparaisons montrent que, chez les deux espèces, les stratégies tenant compte des structures spatiales (Stratspa et SPPCSS) donnent les meilleurs résultats, aussi bien pour l’indice de diversité globale que pour la représentativité des cartes.
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Déposant : Migration Prodinra <>
Soumis le : dimanche 7 juin 2020 - 12:40:26
Dernière modification le : vendredi 12 juin 2020 - 10:43:26

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  • HAL Id : hal-02838498, version 1
  • PRODINRA : 161830

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François Balfourier, Gilles Charmet, Jean-Marie Prosperi, Michel Goulard, Pascal Monestiez. Comparaison de différentes stratégies spatiales d'échantillonnage d'une core collection parmi des populations naturelles d'espèces fourragères. Colloque BRG/USTL. Méthodologie de gestion et de conservation des ressources génétiques, Oct 1997, Lille, France. ⟨hal-02838498⟩

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