Caractérisation des pathotypes de Hernie des Crucifères en France et mise au point d’un test pour l’évaluation de la résistance des variétés de colza - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Article Dans Une Revue Innovations Agronomiques Année : 2016

Clubroot disease: characterization of pathotypes and development of resistance test to evaluation winter oil seed rape varieties

Caractérisation des pathotypes de Hernie des Crucifères en France et mise au point d’un test pour l’évaluation de la résistance des variétés de colza

Résumé

Plasmodiophora brassicae causes the clubroot disease in Brassica crops. This soil-borne pathogen is responsible for the development of galls on the root system of the host plant, disturbing water and mineral nutrition, which leads to significant yield losses. In order to develop a protocol to evaluate the resistance of winter oilseed rape (WOSR) varieties to P. brassicae, the distribution and the characterization of the P. brassicae pathotypes on the French cultivated territory were studied. Field sampling was performed in the main production areas of WOSR (Centre, Bourgogne, Lorraine and Poitou-Charentes) and of cruciferous vegetables (Bretagne). A total of 70 samples was analyzed. Pathotypes P1 to P6 were identified, with P1, P2 and P3 being the most frequent ones. More than half of the isolates were identified as P1. Several isolates belonging to pathotypes P1, P2 and P3 were able to overcome the resistance « Mendel » (resistant variety for control and reference). Isolates from the most frequent pathotypes observed in France (P1, P2 and P3) were chosen in order to test WOSR varieties for resistance to P. brassicae. A complete protocol to evaluate resistance has been proposed to the French variety registration committee. This protocol is now currently used by GEVES to evaluate resistance of WOSR varieties for registration.
Plasmodiophora brassicae est l’agent causal de la hernie, une des principales maladies des Brassicacées. Ce parasite tellurique provoque la formation de galles sur le système racinaire de la plante hôte. Ces galles perturbent gravement l'alimentation hydrique et minérale de la plante entrainant des pertes de rendement. Afin de développer un test d’évaluation de la résistance des variétés de colza à P. brassicae, une étude visant à identifier et localiser les différents pathotypes présents en France a été initiée. L’échantillonnage a eu lieu dans les principales zones de production du colza (le Centre, la Bourgogne, la Lorraine et le Poitou-Charentes) et des crucifères légumières (Bretagne). Au total, 70 échantillons ont été caractérisés. Les pathotypes P1 à P6 ont été identifiés sur tout le territoire dans des proportions variables avec une forte présence des pathotypes P1, P2 et P3. Plus de la moitié des isolats ont été identifiés comme pathotype P1. De nombreux isolats caractérisés comme pathotype P1, P2 et P3 ont été capables de contourner la résistance de la variété « Mendel » (variété résistante de référence). Suite à ces résultats, un set d’isolats appartenant aux pathotypes majoritaires et représentatifs du territoire français P1, P2 et P3 a été sélectionné pour l’évaluation de la résistance des variétés de colza à la hernie. Un protocole complet d’évaluation de la résistance a été proposé au CTPS. Ce protocole est actuellement utilisé au GEVES dans le cadre de l’inscription des variétés au catalogue officiel.
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Geoffrey Orgeur, Christophe Jestin, Agnès Delaunay, D. Lebourg, P. Bagot, et al.. Caractérisation des pathotypes de Hernie des Crucifères en France et mise au point d’un test pour l’évaluation de la résistance des variétés de colza. Innovations Agronomiques, 2016, 50, pp.145-155. ⟨10.15454/1.472115898467224E12⟩. ⟨hal-03315826⟩
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