Plasmides inducteurs de tumeurs (Ti) et inducteurs de racines (Ri) deAgrobacteriumqui présentent une grande diversité sont impliquées dans la galle du collet et les maladies des racines velues. Leurs relations phylogénétiques ont été déduites d'un ensemble exhaustif de plasmides Ti et Ri (dont 36 nouveaux plasmides Ti complets) en se concentrant sur l'ADN-T et les régions de virulence. Le contenu en gènes d'opine synthase des ADN-T a révélé 13 types d'opines correspondant aux anciennes classifications basées sur les opines détectées dans les plantes malades, tandis que le contenu en gènes d'ADN-T sépare plus finement les types d'opines dans 18 organisations d'ADN-T. Cette classification a été étayée par la phylogénie des oncogènes d'ADN-T des plasmides Ti. Les cinq organisations de gènes trouvées dans les régions vir Ti/Ri étaient soutenues par la phylogénie des gènes vir communs. L'organisation vir s'est avérée être probablement un trait plasmidique ancestral séparant les plasmides Ti "classiques" (avec un ou deux ADN-T) et les plasmides "Ri et vigne-Ti".phylogénie repABC . Les ADN-T ont probablement évolué plus tard avec l'acquisition de caractéristiques d'opine comme dernières étapes de l'évolution du plasmide Ti/Ri. Cette nouvelle classification évolutive des plasmides Ti/Ri s'est avérée pertinente pour l'épidémiologie précise de la galle du collet et de la racine poilue.