Le brunissement ou la brunification de l'eau fait référence à l'augmentation de la couleur de l'eau, souvent liée à l'augmentation de la teneur en matière organique dissoute (DOM) et en carbone (DOC) dans les eaux douces. Le brunissement a été reconnu comme un phénomène physico-chimique important altérant les lacs boréaux, mais notre compréhension de ses conséquences écologiques dans différents habitats et régions d'eau douce est limitée. Ici, nous passons en revue les conséquences du brunissement sur différents habitats d'eau douce, les réseaux trophiques et le couplage habitat aquatique-terrestre. Nous examinons les tendances mondiales du brunissement et des DOM/DOC, et l'utilisation de la télédétection comme outil pour étudier le brunissement de l'échelle locale à l'échelle mondiale. Les études se sont concentrées sur les lacs et les rivières tout en abordant rarement les effets à l'échelle du bassin versant. D'autres habitats d'eau douce tels que les petits plans d'eau temporaires ont été négligés, rendant incomplète l'étude de l'ensemble du réseau du bassin versant. Alors que les recherches antérieures ont étudié la réponse des producteurs primaires, des invertébrés aquatiques et des poissons, les effets du brunissement sur les macrophytes, les espèces envahissantes et les réseaux trophiques ont été peu étudiés. La recherche s'est concentrée sur les habitats d'eau douce sans tenir compte des flux entre les habitats aquatiques et terrestres. Nous soulignons l'importance de comprendre comment les changements dans un habitat peuvent se répercuter sur un autre. Le brunissement est un phénomène plus large que la concentration jusqu'ici sur la région boréale. Dans l'ensemble, nous proposons que les études futures améliorent la compréhension écologique du brunissement par les actions de recherche suivantes : 1) accroître nos connaissances sur les processus écologiques de brunissement dans d'autres types de zones humides que les lacs et les rivières,