Impact d'une copule non-Gaussienne dans l'estimation REML du modèle génétique animal bivarié pour des populations sous sélection
Résumé
In the classical multiple-trait animal models used in a genetic context,
variance components are frequently estimated using Restricted Maximum Likelihood method (REML) under the Gaussian assumption for the bivariate traits. Nevertheless, in
practice, this hypothesis is not always realistic. We simulated populations mimicking a
selection schema encountered in pig farming and assessed the impact of a non-Gaussian
multivariate distribution on the residual part generated by a non-Gaussian copula. When
the breeders were selected at random, we did not observe any significant impact on the
estimated parameters despite the underlying Gaussian assumption. Nevertheless, when
the breeders were selected in order to improve the two traits, with a truncation selection
process based on BLUP estimation of the breeding values, we observed significant differences with the true parameters, particularly with asymmetric bivariate distributions on
the residual part.
Dans les mod`eles multi-caract`eres utilis´es en g´en´etique animal, les composantes de variances sont tr`es souvent estim´ees par des m´ethodes de maximum de vraisemblance restreinte (REML) sous l’hypoth`ese de normalit´e jointe des caract`eres, bien qu’en
pratique cette hypoth`ese n’est pas toujours r´ealiste. Nous avons simul´e des populations
mimant un sch´ema de s´election classique rencontr´e dans les ´elevages porcins et mesur´e
l’impact d’une distribution multivari´ee non Gaussienne sur les r´esidus (de part une copule
non-Gaussienne) sur les estimations r´ealis´ees en pratique. Les r´esultats ont montr´e que
lorsque les reproducteurs sont s´electionn´es au hasard, nous n’observons aucun impact significatif sur les estim´es, malgr´e l’hypoth`ese Gaussienne sous-jacente. N´eanmoins, lorsque
les reproducteurs sont s´electionn´es de fa¸con `a am´eliorer les deux caract`eres d’int´erˆet par
un processus de troncation bas´e sur les pr´edictions BLUP des valeurs g´en´etiques, on observe des diff´erences significatives avec les param`etres th´eoriques, en particulier avec des
distributions bivari´ees asym´etriques sur la partie r´esiduelle
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