Des potentiels régulateurs des réponses au stress hydrique et à la carence en soufre identifiés grâce à une analyse multi-omiques chez le pois
Résumé
Dans leur environnement naturel, les plantes doivent faire face à plusieurs stress biotiques
et abiotiques au cours de leur cycle de développement. Certains de ces stress peuvent
survenir au même moment – comme le stress hydrique et les carences nutritionnelles – et
peuvent avoir des effets synergiques, antagonistes ou additifs sur les réponses moléculaires
des plantes. Chez le pois (Pisum sativum), il a été observé que l’effet de la carence en soufre
(S) sur la composition protéique des graines peut être atténué lorsque cette carence est
combinée à un stress hydrique (Henriet et al., 2019). Afin de mieux caractériser les réponses
moléculaires du pois au stress hydrique et/ou à la carence en S, une analyse multi-omiques
(transcriptomique, protéomique, métabolomique, ionomique) a été réalisée à partir de
feuilles récoltées à différents jours post-floraison, sur différents lots de plantes ayant subi ou
non un stress hydrique, une carence en S, ou une combinaison des deux stress. Nos analyses
ont révélé que 21% des ARNm, protéines, métabolites et ions qui répondent
significativement aux stress, ont une réponse accentuée lorsque les deux types de stress
sont combinés, suggérant des effets synergiques ou additifs. En utilisant une approche
intégrative de réseau de co-expression, nous avons mis en évidence des gènes fortement
régulés par les changements de concentration en S dans les feuilles. La comparaison des
données de transcriptomique et protéomique nous permet de formuler des hypothèses
quant au niveau de régulation (transcriptionnel ou post-transcriptionnel) des gènes de
réponse aux stress identifiés. Enfin, ce travail nous permet de proposer des listes de gènes
candidats qui pourraient jouer un rôle dans la tolérance des plantes aux situations de multistress.