Le Centre International de Ressources Microbiennes (CIRM) est un Groupe ment d’Intérêt Scientifique (GIS), créé en 2004 par l’INRA, qui a pour vocation la préservation, l’enrichissement et la valorisation de la diversité microbienne présente dans ses collections. Il compte aujourd’hui plus de 22 000 souches de champignons filamenteux, levures et bactéries. Les collections du CIRM ont la particularité d’être spécialisées, les ressources biologiques hébergées étant liées à des thématiques précises : des Levures d’intérêt biotechnologique, des Bactéries d’intérêt alimentaire, pathogènes des animaux et de l’Homme, associées aux Plantes, et des Champignons Filamenteux d’intérêt agro-industriel. Ces collections sont capables d’offrir plus d’une centaine de souches d’une seule et même espèce. Elles représentent ainsi un vivier très intéressant pour la recherche de fonctionnalités d’intérêts dans les domaines de l’agroalimentaire, de la santé et des biotechnologies. Pour investiguer les capacités de ses ressources microbiennes, le GIS CIRM s’est doté de deux outils de criblage, l’un au CIRM dédié aux Bactéries d’Intérêt Alimentaire (CIRM-BIA) de Rennes, et l’autre au CIRM dédié aux ChampIgnons Filamenteux (CIRM-CF) à Marseille, chaque plateforme étant optimisée pour la manipulation des ressources biologiques lui étant propres.