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metagWGS: a workflow to analyse short and long HiFi metagenomic reads Taxonomic profile HiFi vs Short reads assembly

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Joanna Fourquet
  • Function : Author
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Plateforme Bio-Informatique - Génotoul
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Jean Mainguy
  • Function : Author
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Plateforme Bio-Informatique - Génotoul
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Maïna Vienne
  • Function : Author
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Plateforme Bio-Informatique - Génotoul
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Céline Noirot
  • Function : Author
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Plateforme Bio-Informatique - Génotoul
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Pierre Martin
  • Function : Author
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Plateforme Bio-Informatique - Génotoul
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Vincent Darbot
  • Function : Author
Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage
Olivier Bouchez
  • Function : Author
Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique
Adrien Castinel
  • Function : Author
Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique
Sylvie Combes
Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage
Carole Iampietro
  • Function : Author
Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique
Christine Gaspin
Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées
Denis Milan
  • Function : Author
Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique
Cécile Donnadieu
  • Function : Author
Génome et Transcriptome - Plateforme Génomique
Géraldine Pascal
Génétique Physiologie et Systèmes d'Elevage
CV
Claire Hoede
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Unité de Mathématiques et Informatique Appliquées de Toulouse
Plateforme Bio-Informatique - Génotoul
Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées

Keywords

bioInfOmics

Domains

Computer Science [cs] Bioinformatics [q-bio.QM]
Fichier principal
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Origin : Files produced by the author(s)

Claire Hoede  : Connect in order to contact the contributor

https://hal.inrae.fr/hal-03771202

Submitted on : Wednesday, September 7, 2022-10:36:39 AM

Last modification on : Tuesday, January 17, 2023-4:16:13 PM

Long-term archiving on: Thursday, December 8, 2022-6:17:22 PM

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Dates and versions

hal-03771202 , version 1 (07-09-2022)

Identifiers

Cite

Joanna Fourquet, Jean Mainguy, Maïna Vienne, Céline Noirot, Pierre Martin, et al.. metagWGS: a workflow to analyse short and long HiFi metagenomic reads Taxonomic profile HiFi vs Short reads assembly. JOBIM 2022, Jul 2022, Rennes, France. Actes des exposés (keynotes, contributions orales, mini-symposia) : JOBIM2022_proceedings_oral.pdf (23 Mo) et actes des posters et démos : JOBIM2022_proceedings_posters_demos.pdf (19 Mo). ⟨10.15454/1.5572369328961167E12⟩. ⟨hal-03771202⟩

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