Le cobalt est un métal essentiel qui constitue l'atome central de la vitamine B12. Dans les eaux naturelles, il est présent à l’état de trace (généralement inférieur à 1 μg/L). Toutefois, dans le contexte actuel de transition énergétique, l’intensification de son extraction entraine une augmentation de ses concentrations dans l’environnement, et en particulier dans les milieux aquatiques, au cours de la dernière décennie. L'objectif de cette étude est donc d'examiner les effets de dose du cobalt et de durée d’exposition croissante sur les diatomées périphytiques. Pour cela, des biofilms matures colonisés sur des lames de verre dans l’eau du Gave de Pau ont été exposés à des concentrations croissantes de cobalt (0, 6, 30 et 60 μg/L) pendant 28 jours dans les Rivières Pilotes du Pole d’Études et de Recherche de Lacq (PERL). Les biofilms ont été collectés avant contamination et après 1 heure, 1, 3, 7, 14, 21 et 28 jours d'exposition afin d'analyser la concentration en cobalt bioaccumulée, la biomasse, la teneur en chlorophylle a, la densité et la mortalité des diatomées ainsi que les métabolites produits. Le cobalt était accumulé principalement sous forme intracellulaire dans les biofilms. La quantité de cobalt bioaccumulé était corrélée à la concentration dans l’eau jusqu’à 21 jours d’exposition, confirmant une exposition croissante des organismes au métal. Après 14 jours d’exposition, une diminution de la biomasse et des teneurs en chlorophylle a proportionnelle aux concentrations d’exposition a été mesurée. Concernant les densités de diatomées, une inhibition nette de la croissance était visible pour les concentrations nominales de 30 et 60 μg/L, en particulier après 21 et 28 jours d’exposition. La mortalité, toutefois, restait dans des taux acceptables (généralement <10%). Ces résultats indiquent que le cobalt est susceptible d’impacter négativement les communautés de microalgues dans les milieux à proximité de sites d’extraction et d’activités industrielles, avec des conséquences possibles sur les niveaux trophiques supérieurs.