Ce stage réalisé d'avril à septembre 2000 au Cemagref de Cestas dans l'unité de recherche "qualité des eaux" avait pour thème l'impact des rejets de stations d'épuration sur un écosystème d'eau courante (la Garonne). La Garonne comme plusieurs autres fleuves subit à longueur d'année des prélèvements et rejets susceptibles de modifier fortement son fonctionnement écologique. Tant au niveau régional que national, on s'est inquiété de promouvoir un développement durable respectueux de l'intégrité des écosystèmes aquatiques. Ainsi, le projet écobag sur l'écologie et l'économie du bassin Adour-Garonne a été lancé en 1991. C'est dans ce cadre que vient s'inscrire notre étude. En effet, face à la problématique « la Garonne est-elle eutrophisée ? » des outils ont été mis en place afin de traduire la richesse potentielle du fleuve sur une partie de son cours d'eau au niveau de Toulouse et d'Agen. Pour cela des bioessais sur des culture d'algues ont été mis en oeuvre en laboratoire afin de montrer des phénomènes d'inhibition et de synergie que ne peuvent pas prévoir les seules analyses de nutriments dans l'eau. Afin d'étudier la production de biofilms, élément important à conforter dans le modèle hydroécologique actuel de la Garonne, des canaux miniaturisés alimentés en eau de Garonne et en conditions contrôlées ont été mis en place.