Au cours des dernières décennies, la sélection génétique a contribué à une amélioration considérable des performances des animaux. Mais bien que la composante génétique de la variabilité phénotypique puisse être estimée avec précision, une grande partie de cette variabilité n'est pas directement accessible par les approches actuelles. Dans un contexte de diversification des environnements de production (changement climatique, modes de production plus respectueux du bien-être animal et de l'environnement...), il est nécessaire de comprendre l'impact de l'environnement sur la variation phénotypique via les marques épigénétiques, pour optimiser les systèmes d'élevage et mieux prédire le phénotype d'un animal. Pour améliorer nos capacités d'analyse de ces phénomènes épigénétiques, nous nous appuyons sur les technologies disponibles sur GeT-PlaGe. Les avancées dans ce domaine sont importantes, grâce aux analyses en cours dans le cadre du programme SeqOccIn (Occitanie / Europe), utilisant en particulier la technologie ONT chez la caille et le porc.