Les microorganismes des sols, et en particulier les bactéries, constituent la partie cachée de l'iceberg de la biodiversité. Pendant longtemps délaissés des scientifiques, la nature microscopique, la diversité et le rôle de ces organismes dépassent nos capacités de perception. Pourtant au début des années 2000, des chercheurs se sont lancés le défi d'étudier l'écologie des bactéries des sols à l'échelle de la France métropolitaine. Grâce au Réseau de Mesure de la Qualité des Sols (RMQS), un échantillonnage intensif et systématique de 2200 sols sur le territoire national, et à des outils de biologie moléculaire standardisés et déployés à haut débit, de nombreuses connaissances nouvelles et génériques sur la vie bactérienne des sols ont pu être produites. Après leur validation académique, l'objectif logique a été de les diffuser le plus largement possible à travers un ouvrage grand public. Les deux chapitres introductifs présentent le rôle et l'importance des sols et de leur biodiversité ainsi que les méthodologies employées pour les étudier à l'échelle de la France. Le corps de l'ouvrage est constitué de 3 parties décrivant successivement les communautés (biomasse microbienne, richesse et structure des communautés bactériennes, réseau d'interactions bactérien), les 35 groupes taxonomiques bactériens majeurs ainsi que les 16 habitats des bactéries des sols de France. Dans chaque partie, des cartes de distribution et une description complète de la communauté et des taxons sont présentés, associés à une présentation des principaux filtres environnementaux. L'ensemble de ces connaissances scientifiques présentées dans cet atlas constitue le pré-requis à la conception de bioindicateurs de la qualité microbiologique applicable au terrain, à l'élaboration d'outils de diagnostic opérationnel pour évaluer l'impact des pratiques agricoles et au développement d’une expertise scientifique pour l'interprétation écologique du diagnostic. Cet ouvrage cible une large gamme de lecteur, depuis les étudiants aux chercheurs, en passant par tous les acteurs du sol, avec pour objectif de renforcer l'intérêt et les connaissances communes sur la biodiversité du sol.