A l’échelle locale, les diatomées sont historiquement reconnues comme particulièrement sensibles aux gradients liés à la balance ionique des eaux (alcalinité/acidité et conductivité) (Potapova et Charles, 2003 ; Tison et al., 2005), et aux concentrations en nutriments (phosphates et nitrates) (Winter et Duthie, 2000; Soininen et al., 2016). Ces travaux permettent d’associer à de nombreuses espèces clés des valeurs de sensibilité à tel ou tel paramètre de l’eau, ainsi que des valeurs d’amplitude écologique (quelle gamme de variation du paramètre en question est supportée) ou sténoécie. Sensibilité et sténoécie sont des valeurs essentielles à toute quantification d’impact subi par une communauté. Or les récents travaux de l’équipe (Bottin et al., 2014, 2016 ; Soininen et al., 2016 ; Jamoneau et al., 2017) montrent qu’au niveau du système hydrographique français, les assemblages de diatomées présentent certes une structure en relation étroite avec les paramètres de l’environnement, mais également en lien avec les capacités de dispersion des espèces. Ces conclusions rejoignent celles de nombreux chercheurs opposés à l’idée du cosmopolitisme des micro-organismes et démontrant que ceux-ci présentaient des patrons biogéographiques similaires à ceux des macro-organismes (Vyverman et al., 2007 ; Verleyen et al. 2009). Les assemblages diatomiques semblent donc montrer une structuration complexe, dans laquelle la forte dépendance des espèces aux conditions environnementales s’accompagne de processus complémentaires, comme l’influence des dynamiques de dispersion. Ces phénomènes ont pour effet de créer des réponses complexes, non-linéaires et en partie aléatoires des assemblages aux conditions environnementales. Or le modèle implicite utilisé par la bioindication ne prend pas suffisamment en compte cette complexité, et utilise un lien mécanistique entre l’environnement et la réponse de chacune des espèces. Les travaux récemment menés par l’équipe tendent à montrer que certaines espèces généralistes tolérantes pourraient présenter des taux de dispersion locale importants, en grande partie liés à de forts niveaux de productivité (induits notamment par l’eutrophisation générale des cours d’eau), plutôt qu’à des niveaux de pression anthropique précis. C’est le phénomène de « mass effect » (Mouquet et Loreau,). Présentes car d’abord fortement colonisatrices, leur prise en compte en bio-indication pourrait s’avérer problématique : mettre en évidence ces espèces permettrait d’affiner nos méthodes. Caractérisées à l’heure actuelle par des profils écologiques dégradés quel que soit le niveau et la nature de l’impact du moment que le milieu soutien leur forte productivité en amont, elles brouillent le message et rendent les indices peu discriminants dans certaines conditions du milieu. Les recherches envisagées visent à terme à rénover les méthodes de bio-indication actuelles, en révisant les profils écologiques des espèces dont la présence est davantage liée à la dispersion neutre qu’aux paramètres du milieu. Les possibilités d’améliorer le pouvoir discriminant de l’Indice Biologique Diatomées pour les cours d’eau naturellement productifs notamment seront ainsi explorées et testées à l’échelle de l’hydro système français.