Les écosystèmes aquatiques terrestres lotiques sont des milieux particulièrement sensibles aux activités anthropiques (activités agricoles intensives et industrielles, urbanisation, aménagement des cours d'eau, etc.). Ces activités peuvent conduire à une altération de la qualité physico-chimique, des régimes hydrologiques et de la morphologie des cours d'eau et induire une perte de continuité écologique, au sein du réseau hydrographique. Les poissons grands migrateurs, en raison de leur cycle de vie nécessitant des migrations entre les eaux marines et les eaux douces, sont particulièrement vulnérables à ces pertes de continuité écologique. Historiquement, le bassin de la Seine comptait dix espèces de poissons grands migrateurs. L’aménagement du cours d'eau pour la navigation et la pollution des eaux du bassin, a alors conduit à la disparition temporaire de certaines espèces dans les années 70s, notamment le saumon Atlantique. Aujourd'hui, grâce aux efforts réalisés, certaines espèces recolonisent progressivement le bassin. La présente étude s’intéresse au cas particulier de la truite de mer sur une rivière affluente à la Seine fortement anthropisée : la Mauldre. Les objectifs de l’étude sont d'identifier la présence de frayères potentielles sur le cours d’eau et d’évaluer leur accessibilité, par l’intermédiaire d’une modélisation de la continuité écologique utilisant l’approche du chemin de moindre coût. L’impact des principales barrières à la migration a été évalué. Les ouvrages hydrauliques perturbants le plus la libre circulation piscicole et les pollutions physico-chimiques ont été identifiés. Des scénarios d’effacement progressifs d’ouvrages de l’aval vers l’amont, ainsi que les scénarios d’amélioration de la qualité de l’eau, ont permis de mettre en évidence les actions à cibler pour restaurer la continuité écologique et permettre la recolonisation de la truite de mer, une espèce indicatrice du bon état des cours d’eau dulçaquicoles.