GExEc : Application pour la Gestion des Expérimentations et des Echantillons - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Access content directly
Conference Poster Year : 2023

GExEc : Application pour la Gestion des Expérimentations et des Echantillons

Abstract

Dix ans auparavant, au sein de l’unité URP3F, nous avions entamé une réflexion sur notre gestion des échantillons, mais celle-ci n’avait pas abouti car les différentes équipes n’avaient pas trouvé d’accord pour harmoniser les noms des échantillons, notamment ceux en lien avec des partenaires extérieurs. Fin 2021, 3 correspondants qualité de centres INRAE : Florence BORDERES pour Nouvelle-Aquitaine-Poitiers, Céline PIRE LAIGLE pour Pays de la Loire et Jean Noël THIBAULT pour Bretagne – Normandie, se sont associés pour proposer une démarche d’accompagnement sur la gestion des échantillons aux unités volontaires de ces 3 centres, tout au long de l’année 2022. Dans cette démarche, une étape consiste à choisir une méthode ou un outil de gestion. Or, après avoir testé des outils tels que Barcode ou Open Science, notre groupe de travail a jugé qu’ils ne convenaient pas à nos besoins. C’est pourquoi j’ai développé en interne une application sur la base que ce que j’avais déjà réalisé pour « Supervisio » présenté aux J2M 2021 ; associant une interface utilisateur à une base de données. Aussi, pour pallier à un autre problème rencontré dans l’unité concernant la pérennité des historiques d’expérimentation, j’ai créé un outil commun à la Gestion des Expérimentations et des Echantillons, baptisé « GExEc ». Un échantillon, ou sous-échantillon possède un nom unique, mais l’idée qui a permis de fédérer toutes les équipes de l’unité est de pouvoir y associer un alias spécifique pour chaque organisation qui travaille sur un même échantillon. Ainsi, les laboratoires de Chimie et Biotechnologie de l’unité peuvent continuer à partager des échantillons avec leurs partenaires selon des critères spécifiques de nommage et de faire le lien en interne avec les autres équipes de l’unité. L’application est accessible par un navigateur web. Après vous être inscrit, vous pourrez vous connecter via un compte personnel ou votre LDAP pour visualiser les expérimentations ou les échantillons en fonction de vos filtres de recherche qui restent mémorisés. En fonction de vos droits (observateur, éditeur ou administrateur), pour les échantillons vous pourrez : en créer, effectuer des modifications/interventions, les importer/exporter vers Excel, générer un fichier PDF pour imprimer des étiquettes à différentes tailles avec ou sans code-barres, etc. Vous pourrez également paramétrer vos organisations (unité ou société, équipe, groupe) et renseigner directement ou importer des jeux de paramètres depuis Excel tels que : les responsables, les espèces, les variétés, la provenance, le stockage, les contenants, les traitements, les analyses, etc. Dans l’objectif d’ouvrir l’accès de cet outil à d’autres unités du centre, j’ai demandé, sur ARIANE, la création d’une machine virtuelle sur un datacenter INRAE, la configuration d’un DNS ainsi que la création de certificats TLS de sécurité pour configurer Node-red et InfluxDB en connexion HTTPS. J’ai aussi contacté le délégué à la protection des données à caractère personnel (DPO) pour être en conformité avec le RGPD, qui m’a orienté vers la simple mise en ligne d’une mention d’information. Comme pour « Supervisio », dans Node-red, j’ai utilisé des « nodes Template » codés en HTML et javascript pour générer des pages web qui font appel aux Framework AngularJS et Bootstrap et aux librairies jQuery, JsBarcode-master, jsPDF-master, etc. Il est prévu de faire évoluer l’application en y ajoutant la possibilité de gérer des pools d’échantillons. J’ai déjà créé une application qui associe directement la pesée d’une balance à l’échantillon, mais elle reste à être déployée dans l’unité.
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Origin : Files produced by the author(s)
Licence : CC BY - Attribution

Dates and versions

hal-04233340 , version 1 (09-10-2023)

Identifiers

  • HAL Id : hal-04233340 , version 1

Cite

Cédric Perrot, Florence Bordères. GExEc : Application pour la Gestion des Expérimentations et des Echantillons. 17èmes journées de la mesure et de la métrologie (J2M), Oct 2023, Sètes, France. ⟨hal-04233340⟩
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