A collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean evolution: The World Asellidae database - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Molecular Ecology Resources Année : 2023

A collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean evolution: The World Asellidae database

Nathanaelle Saclier (1) , Louis Duchemin (2, 3) , Lara Konecny-Dupré (3) , Philippe Grison (4) , David Eme (5) , Chloé Martin (6, 7) , Cécile Callou (4, 8) , Tristan Lefébure (3) , Clémentine François (3) , Colin Issartel (3) , Julian Lewis (9) , Fabio Stoch (10) , Boris Sket (11) , Sanja Gottstein , Teo Delić (12) , Maja Zagmajster , Michal Grabowski (13) , Dieter Weber (14, 15) , Ana Sofia P. S. Reboleira (16) , Dmitry Palatov , Kaloust Paragamian , Lee Knight , Georges Michel (17) , Francois Lefebvre , Mohammad‐javad Malek Hosseini , Ana Camacho , Begoña Gartzia de Bikuña , Amina Taleb , Nouria Belaidi , Raoul Tuekam Kayo , Diana Maria Paola Galassi , Oana Teodora Moldovan , Christophe Douady (3) , Florian Malard (3)
1 UMR ISEM - Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
2 Le Cocon
3 E3S - Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
4 BBEES - Bases de données sur la Biodiversité, Ecologie, Environnement et Sociétés
5 RiverLy - RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes
6 EVEHA (Etudes et valorisations archeologiques)
7 AMARAI - Association Manche Atlantique pour la Recherche Archéologique dans les îles
8 AASPE - Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements
9 Department of Invertebrate Zoology, U.S. National Museum of Natural History, Smithsonian Institution, USA
10 ULB - Université libre de Bruxelles
11 Oddelek za biologijo
12 SubBioLab [Ljubljana, Slovénie]
13 Department of Invertebrate Zoology and Hydrobiology
14 Senckenberg Deutsches Entomologisches Institut Müncheberg
15 MNHN Luxembourg - Musée National d'Histoire Naturelle de Luxembourg
16 Natural History Museum of Denmark
17 GIGA [Université Liège]
Nathanaelle Saclier
Institut des Sciences de l'Evolution de Montpellier
Louis Duchemin
Le Cocon
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
Lara Konecny-Dupré
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
Philippe Grison
  • Fonction : Auteur
Bases de données sur la Biodiversité, Ecologie, Environnement et Sociétés
David Eme
RiverLy - Fonctionnement des hydrosystèmes
Chloé Martin
  • Fonction : Auteur
EVEHA (Etudes et valorisations archeologiques)
Association Manche Atlantique pour la Recherche Archéologique dans les îles
Cécile Callou
Bases de données sur la Biodiversité, Ecologie, Environnement et Sociétés
Archéozoologie, archéobotanique : sociétés, pratiques et environnements
CV
Tristan Lefébure
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
CV
Clémentine François
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
Colin Issartel
  • Fonction : Auteur
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
Julian Lewis
  • Fonction : Auteur
Department of Invertebrate Zoology, U.S. National Museum of Natural History, Smithsonian Institution, USA
Fabio Stoch
Université libre de Bruxelles
Boris Sket
Oddelek za biologijo
Sanja Gottstein
Teo Delić
SubBioLab [Ljubljana, Slovénie]
Maja Zagmajster
Michal Grabowski
Department of Invertebrate Zoology and Hydrobiology
Dieter Weber
Senckenberg Deutsches Entomologisches Institut Müncheberg
Musée National d'Histoire Naturelle de Luxembourg
Ana Sofia P. S. Reboleira
Natural History Museum of Denmark
Dmitry Palatov
Kaloust Paragamian
Lee Knight
  • Fonction : Auteur
Georges Michel
  • Fonction : Auteur
GIGA [Université Liège]
Francois Lefebvre
  • Fonction : Auteur
Mohammad‐javad Malek Hosseini
Ana Camacho
Begoña Gartzia de Bikuña
Amina Taleb
Nouria Belaidi
Raoul Tuekam Kayo
Diana Maria Paola Galassi
Oana Teodora Moldovan
Christophe Douady
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains
CV
Florian Malard
Équipe 3 - Écologie, Évolution, Écosystemes Souterrains

Résumé

Abstract Transition to novel environments, such as groundwater colonization by surface organisms, provides an excellent research ground to study phenotypic evolution. However, interspecific comparative studies on evolution to groundwater life are few because of the challenge in assembling large ecological and molecular resources for species‐rich taxa comprised of surface and subterranean species. Here, we make available to the scientific community an operational set of working tools and resources for the Asellidae, a family of freshwater isopods containing hundreds of surface and subterranean species. First, we release the World Asellidae database (WAD) and its web application, a sustainable and FAIR solution to producing and sharing data and biological material. WAD provides access to thousands of species occurrences, specimens, DNA extracts and DNA sequences with rich metadata ensuring full scientific traceability. Second, we perform a large‐scale dated phylogenetic reconstruction of Asellidae to support phylogenetic comparative analyses. Of 424 terminal branches, we identify 34 pairs of surface and subterranean species representing independent replicates of the transition from surface water to groundwater. Third, we exemplify the usefulness of WAD for documenting phenotypic shifts associated with colonization of subterranean habitats. We provide the first phylogenetically controlled evidence that body size of males decreases relative to that of females upon groundwater colonization, suggesting competition for rare receptive females selects for smaller, more agile males in groundwater. By making these tools and resources widely accessible, we open up new opportunities for exploring how phenotypic traits evolve in response to changes in selective pressures and trade‐offs during groundwater colonization.

Domaines

Sciences du Vivant [q-bio]

David Eme  : Connectez-vous pour contacter le contributeur

https://hal.inrae.fr/hal-04313500

Soumis le : mercredi 29 novembre 2023-10:57:48

Dernière modification le : jeudi 25 avril 2024-03:27:16

Consulter le texte intégral

Dates et versions

Identifiants

Citer

Nathanaelle Saclier, Louis Duchemin, Lara Konecny-Dupré, Philippe Grison, David Eme, et al.. A collaborative backbone resource for comparative studies of subterranean evolution: The World Asellidae database. Molecular Ecology Resources, 2023, 24 (1), ⟨10.1111/1755-0998.13882⟩. ⟨hal-04313500⟩

Exporter

BibTeX XML-TEI Dublin Core DC Terms EndNote DataCite

Collections

CIRAD MNHN EPHE CNRS INRIA UNIV-LYON1 ENTPE ISEM BIOENVIS PSL UNIV-MONTPELLIER LBBE UDL INRAE INRAE-AQUA ANR RIVERLY LEHNA AASPE BIOEENVIS EVEHA ECOFLOWS
36 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Facebook X LinkedIn More