Le pourcentage de déformations des diatomées est de plus en plus utilisé comme un indicateur de stress toxique dans les cours d’eau. Cependant, ce pourcentage ne permet pas de quantifier l’importance de ce stress. Pour cela, l’applicabilité de la morphométrie géométrique a été testée à l’évaluation de la sévérité de déformations chez les diatomées, à partir d’une espèce modèle : Gomphonema gracile. Cette méthode a pour but d’étudier des variations de formes subtiles et a été utilisée dans le but de mettre en évidence un gradient de déformation chez différents spécimens de diatomées déformées. Sur la base de microphotographies d’individus normaux et déformés, le positionnement des points-repères a été optimisé, puis la méthode de superposition de Procruste a été utilisée pour mettre en évidence les variations morphologiques, en s’affranchissant des différences de taille, d’orientation mais aussi de position. Les résultats de ces analyses montrent l’efficacité de la méthode pour discriminer les individus normaux et déformées à l’aide de 6 points-repères. Cette dernière a ensuite été utilisée seulement sur les diatomées déformées préalablement triées visuellement selon la sévérité de leur déformation. Là encore, la méthode est efficace car elle permet de mettre en évidence un gradient de déformations au sein des individus déformés. Cependant, il est important d’ajouter que cette méthode n’a été testée que pour un type de déformations donné et que par conséquent, cette dernière devra sûrement être réadaptée selon les individus.