FAIDARE - FAIR Data-finder for Agronomic REsearch
FAIDARE - FAIR Data-finder for Agronomic REsearch
Résumé
FAIDARE (https://urgi.versailles.inrae.fr/faidare/) is a data discovery portal that allows searching over more than forty plant research databases over the world. It eases datasets findability and access of most plant research data types, including in particular genotyping, phenotyping and germplasms. It is based on the Breeding API (BrAPI, https://brapi.org/) specifications and has been developed with the ELIXIR Plant Sciences community (https://elixir-europe.org/communities/plant-sciences), the EMPHASIS infrastructure and INRAE plant and forest communities.
FAIDARE offers a user-friendly interface allowing keyword based search completed by specific filters. The search results include a general description with a link back to the original database to allow data access, plus summary cards for some data types. It also provides a standard web services interface (API) to allow programmatic search and access.
FAIDARE is hosted by PlantBioinfoPF, the URGI plant bioinformatics platform (https://urgi.versailles.inrae.fr/).
FAIDARE (https://urgi.versailles.inrae.fr/faidare/) est un portail de découverte de données qui permet d'effectuer des recherches dans plus de quarante bases de données internationales sur les plantes. Il facilite la recherche et l'accès à la plupart des types de données en recherche végétale, notamment le génotypage, le phénotypage et les germplasmes. Il est basé sur les spécifications de la Breeding API (BrAPI, https://brapi.org/) et a été développé avec la communauté ELIXIR Plant Sciences (https://elixir-europe.org/communities/plant-sciences), l'infrastructure EMPHASIS et les communautés végétales et forestières d'INRAE.
FAIDARE offre une interface simple permettant une recherche par mot-clé complétée par des filtres spécifiques. Les résultats de la recherche comprennent une description générale avec un lien vers la base de données d'origine pour permettre l'accès aux données, ainsi que des fiches récapitulatives pour certains types de données. Il fournit également une interface de services web standard (API) pour permettre la recherche et l'accès programmatiques.
FAIDARE est hébergé par PlantBioinfoPF, la plate-forme bioinformatique végétale de l'URGI (https://urgi.versailles.inrae.fr/).
