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Thèse

Étude de la biodiversité des bactéries symbiotiques des nématodes entomopathogènes, définition de nouvelles espèces, et mise en évidence d'une co-spéciation

Résumé : Les bactéries associées aux nématodes entomopathogènes (Steinernema et Heterorhabditis), issus d'une enquête biogéographique dans les Antilles, ont été isolées et caractérisées. La diversité des symbiotes Xenorhabdus et Photorhabdus a été déduite de l'analyse du polymorphisme de restriction de l'ADN ribosomique (ADNr) 168 amplifié par PCR (Polymerase Chain Reaction), et a été comparée aux données sur l'origine des isolats. Aux Antilles, le genre Xenorhabdus est très peu représenté et très divers, à l'inverse du genre Photorhabdus. La diversité génotypique de ces bactéries est expliquée par la diversité des espèces d'hôtes. Les résultats de cette analyse nous ont permis d'aborder la systématique des genres Photorhabdus et Xenorhabdus avec une image plus explicite de leur biodiversité. En combinant des données génomiques (hybridations ADN-ADN et comparaison des séquences de l'ADNr 16S) et phénotypiques, de nouvelles espèces et sous-espèces ont été proposées dans le genre Photorhabdus. Ces travaux représentent un apport considérable à la taxinomie du genre Photorhabdus, jusqu'alors non résolue, et mettent en évidence l'extrême diversité du genre Xenorhabdus, où de nouvelles espèces sont à décrire. Dans les deux cas, les structures taxinomiques des hôtes et des symbiotes se superposent, indiquant un phénomène de co-spéciation entre les partenaires de la symbiose.
Type de document :
Thèse
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https://hal.inrae.fr/tel-02842362
Déposant : Migration Prodinra <>
Soumis le : dimanche 7 juin 2020 - 15:38:51
Dernière modification le : vendredi 12 juin 2020 - 10:43:26

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  • HAL Id : tel-02842362, version 1
  • PRODINRA : 70177

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Marion Fischer-Le Saux. Étude de la biodiversité des bactéries symbiotiques des nématodes entomopathogènes, définition de nouvelles espèces, et mise en évidence d'une co-spéciation. Sciences du Vivant [q-bio]. Université Montpellier 2 (Sciences et Techniques), 1999. Français. ⟨tel-02842362⟩

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