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Other Publications Year : 2016

SS4I: select SNP subset for imputation

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Abstract

Ce logiciel, développé en Python, permet de sélectionner un panel réduit de SNP pour la réalisation de puce basse densité et pour l'imputation vers des données de génotypage de haute densité. La sélection de SNP s'effectue en tenant compte du déséquilibre de liaison (r2) entre les différentes pairs de SNP au sein d'un chromosome.
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Dates and versions

hal-01455929 , version 1 (03-02-2017)

Identifiers

  • HAL Id : hal-01455929 , version 1
  • PRODINRA : 375448

Cite

Frédéric Herault, Jérémy Yon, Florian Herry, Sophie Allais, Pascale Le Roy. SS4I: select SNP subset for imputation. 2016. ⟨hal-01455929⟩
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