Ce texte introduit le dossier regroupant les communications faites par des chercheurs du département SAE2 lors de la journée du 15 novembre 2006, consacrée à la présentation de travaux sur le thème entreprises et filières agroalimentaires face à de nouveaux enjeux. Il rappelle le contexte dans lequel évolue l'industrie agroalimentaire française et évoque les enjeux auxquels cette industrie est confrontée, certains de ces enjeux étant plus spécialement analysés dans les travaux figurant dans le dossier.