Modélisation dynamique des mécanismes de signalisation induits par l'hormone folliculo-stimulante et l'angiotensine - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Theses Year : 2011

Modélisation dynamique des mécanismes de signalisation induits par l'hormone folliculo-stimulante et l'angiotensine

Abstract

Seven transmembrane receptor (7TMR) signaling controls the main human physiological functions. R7TMs are targeted by drugs and initiate large and complex networks responsible for physiological eff ects. In this thesis, we dynamically modelled the FSHR-induced network that have critical role in reproduction and the angiotensin receptor-induced network which regulates blood presure and is considered as a model 7TMR with the objective to understand their mechanisms of functionning and to predict experimentally unreachable data. Our modeling, based on ODE formalism, assumes each species as a variable and each kinetic rate as a parameter. Some parameters were unknown and required an adjustment. This led us to develop an environement allowing the comparaison of existing adjustment methods and to create a novel and efficient hybrid method well-adapted to the parametrization of signaling networks.
La signalisation cellulaire induite par les r écepteurs à sept domaines transmembranaires (R7TM) contrôle les principales fonctions physiologiques humaines. Ces R7TMs sont cibles de m édicaments et initient de larges réseaux d'interactions. Nous avons modélisé dynamiquement les réseaux de signalisation du récepteur à l'hormone folliculo-stimulante (FSH) régulant la fonction de reproduction et du récepteur angiotensine, un R7TM modèle régulant la tension pour comprendre le fonctionnement de ces réseaux et prédire des données inaccessibles expérimentalement. Notre modélisation a utilisé des équations différentielles ordinaires, en assimilant une variable par espèce et un paramètre par constante cinétique. Les paramètres manquant ont été déterminés par optimisation paramétrique. Puis, nous avons d éveloppé un environnement afin de comparer plusieurs algorithmes d'optimisation et de créer une nouvelle méthode hybride plus performante et adaptée à la paramétrisation des réseaux de signalisation.
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Dates and versions

tel-00847767 , version 2 (24-07-2013)
tel-00847767 , version 1 (06-06-2020)

Identifiers

  • HAL Id : tel-00847767 , version 2
  • PRODINRA : 46299

Cite

Domitille Heitzler. Modélisation dynamique des mécanismes de signalisation induits par l'hormone folliculo-stimulante et l'angiotensine. Bio-Informatique, Biologie Systémique [q-bio.QM]. Université François Rabelais - Tours, 2011. Français. ⟨NNT : ⟩. ⟨tel-00847767v2⟩
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