Les approches expérimentales en canaux dynamiques permettent d'étudier l'impact de la toxicité des herbicides agricoles, couplée à l'influence des facteurs trophiques, sur la communauté diatomique. Ces micro-algues sont des indicateurs biologiques connus et l'Indice Biologique Diatomées (IBD) est un outil d'évaluation de la qualité de l'eau largement utilisé dans le cadre de la Directive Cadre européenne sur l'Eau (DCE). Il est capable de mettre en évidence les pollutions trophiques et organiques, mais reste insuffisant concernant la détection d'effets des pollutions par les pesticides. Ainsi, afin de compléter les connaissances sur ce sujet, des expérimentations contrôlées en aquariums ont été réalisées en appliquant des modalités variables de concentration en herbicides et en nutriments, d'un microcosme à l'autre. Après avoir ensemencé chaque unité expérimentale avec une suspension périphytique et observé une période de colonisation de trois semaines sur des substrats artificiels, le biofilm a été analysé en fonction de ses caractéristiques quantitatives (concentration en chlorophylle a, densité cellulaire de diatomées) et qualitatives (abondances relatives, IBD). Les résultats obtenus semblent montrer une répartition des espèces dépendante de leur affinité pour les milieux oligotrophes ou eutrophes mais la présence d'herbicide, à des concentrations environnementales rencontrées sur le terrain, ne semble pas avoir d'impacts majeurs sur la composition de la communauté diatomique.