Phénotypage racinaire haut débit et ses applications à l'étude des interactions plante x microorganisme
Résumé
De nombreuses innovations ont été développées afin de caractériser le fonctionnement des plantes modèles ou cultivées. Ces innovations comprennent de nouvelles méthodes et équipements dédiés à l’analyse des plantes et la gestion des données associées. Ils permettent d’analyser dans des conditions climatiques variées la morphologie, la phénologie et le fonctionnement physiologique des plantes résultant de l’expression de leurs gènes, ce que l’on appelle le « phénotype » d’une plante. Ceci est réalisé à « haut débit » par le biais de la caractérisation non destructive, dynamique et automatisée des phénotypes de milliers de plantes et l’acquisition des données microclimatiques permettant de caractériser l’environnement des plantes. Le phénotypage haut débit des parties racinaires ainsi que celui de leurs interactions avec les microorganismes telluriques attirent de plus en plus l’attention des chercheurs. Considérant leur impact majeur sur la santé et la croissance des plantes, en particulier en conditions de stress, il y a là de gros enjeux méthodologiques et scientifiques pouvant conduire à des avancées majeures en sélection variétale.