C’est un enjeu environnemental et de santé publique majeur. Les eaux usées sont devenues l’un des principaux vecteurs de micropolluants - et de pathogènes - vers le milieu naturel. Dans les stations d’épuration, des chercheurs de l’Inra de Narbonne tentent de comprendre le devenir des micropolluants dans les eaux et les boues. D’autres, en Avignon, s’intéressent au devenir de ces eaux usées dans l’environnement. D’autres encore, à Thonon, ont étudié les impacts de diverses pollutions mais aussi de perturbations beaucoup plus anciennes sur les lacs alpins. Tous cherchent à modéliser le devenir des pollutions dans l’écosystème pour anticiper, voire même prévoir leur évolution en réaction à des perturbations d’origine naturelle ou anthropique.