La séquence du génome de la poule et ses applications en sélection - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Productions Animales Année : 2006

The chicken genome sequence and its utility for breeding

La séquence du génome de la poule et ses applications en sélection

Résumé

In December 2004, the first version of the chicken genome sequence was published three years only after the human one. This work is theresult of more than ten years of research in the field of chicken genomics, started by the realisation of the first genetic maps, followed bythat of BAC clone libraries, cytogenetic maps including the microchromosomes, radiation hybrid maps and the production of EST.Indeed, all the mapping data available help in the assembly of the final sequence. Of course, similar to the first version of the humansequence assembly, the chicken one is not perfect and improvements, in particular for the microchromosomes, will be necessary. Also, thetask of annotating the genome will have to be pursued. However, the fact of having the genome sequence of an increasing number of vertebrateanimals will enable to refine our knowledge through comparative studies. The availability of the chicken genome sequence willenable to replace much of the molecular biology work that was necessary for the determination of the structure, function and polymorphismof genes by performing in silico analyses. This should accelerate the development of molecular markers usable for the selection ofphenotypes of interest in livestock production systems.
En décembre 2004, soit trois ans seulement après celle de l’homme, la première version de la séquence du génome de la poule a été publiée. Ce travail est le résultat de plus de dix années de recherches en génomique. Celles-ci ont débuté par la réalisation des premières cartes génétiques, puis de banques de clones BAC*, de cartes cytogénétiques incluant les microchromosomes, de cartes d’hybrides irradiés et la production de séquences d’EST. En effet, c’est la mise en commun de l’ensemble de ces données disponibles qui a contribué à l’assemblage final de la séquence. Bien entendu, comme la première version de celle du génome humain, la séquence de la poule n’est pas parfaite et des travaux de vérification et de corrections, notamment des microchromosomes, seront nécessaires. De plus, un effort d’annotation* est maintenant à réaliser. Cependant, le fait de disposer de la séquence du génome d’un nombre croissant de vertébrés va permettre d’affiner nos connaissances grâce aux études comparatives. La disponibilité de la séquence de la poule va permettre de remplacer une bonne partie des longs et fastidieux travaux de biologie moléculaire nécessaires à la détermination de la structure, de la fonction et du polymorphisme des gènes par des analyses in silico. Ceci devrait accélérer la mise au point de marqueurs moléculaires utilisables pour la sélection de phénotypes intéressants pour les productions animales.
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Identifiants

  • HAL Id : hal-02664615 , version 1
  • PRODINRA : 3289
  • WOS : 000240575200004

Citer

Alain Vignal, B. Besbes. La séquence du génome de la poule et ses applications en sélection. Productions Animales, 2006, 19 (2), pp.109-118. ⟨hal-02664615⟩
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