Pour étudier la morphologie des racines de graminées prairiales qui sont très fines, nous avons amélioré un protocole permettant d’obtenir avec un scanner des images qui sont ensuite analysées avec un logiciel commercialisé (WinRhizo). Les racines, une fois lavées, sont colorées au bleu de méthylène et numérisées avec un scanner. Les images obtenues sont traitées avec le logiciel qui permet de mesurer la longueur et le diamètre des racines. Ces informations sont récupérées sous forme de fichiers texte et facilement importables sur Microsoft Excel. La finesse des racines des graminées prairiales nous a conduits à développer un protocole adapté à leur morphologie. L’obtention d’images de très bonne qualité reste un objectif majeur pour toute analyse d’image. La coloration des racines pour augmenter le contraste, leur séparation pour éviter tout chevauchement, le positionnement sur le scanner sont toutes des étapes importantes pour une utilisation plus facile du logiciel WinRhizo. Toutefois nous avons dû réaliser des tests pour trouver les réglages adaptés pour analyser les images avec le logiciel. En ce qui concerne les résultats, nous obtenons une grande quantité de données à traiter, et il est impératif d’automatiser les opérations de traitements pour pouvoir se concentrer sur la numérisation, qui est la clef de tous les résultats.