Hétérogénéité des variances de caractère d'animaux de race Montbéliarde - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Genetics Selection Evolution Année : 1997

Heterogeneity of variance for type traits in the Montbeliarde cattle breed

Hétérogénéité des variances de caractère d'animaux de race Montbéliarde

Résumé

This paper presents and discusses the estimation of genetic and residual (co-) variance components for conformation traits recorded in different environments using mixed linear models. Testing procedures for genetic parameters (genetic correlations between environments constant or equal to one, genetic correlation equal to one and constant intra-class correlations, homogeneity of variance-covariance components) are presented. These hypotheses were described via heteroskedastic univariate sire models taking into account genotype x environment interaction. An expectation-maximization (EM) algorithm was proposed for calculating restricted maximum likelihood (REML) estimates of the residual and genetic components of variances and co-variances. Likelihood ratio tests were suggested to assess hypotheses concerning genetic parameters. The procedures presented in the paper were used to analyze and to detect sources of variation on conformation traits in the Montbeliarde cattle breed using 24 301 progeny records of 528 sires. On all variables analyzed, several sources (stage of lactation, classifiers, type of housing) of heterogeneity of residual and genetic variances were clearly highlighted, but intra-class correlations between environments of type traits remained generally constant.
Cet article présente et discute l’estimation des composantes de (co)variance (génétiques et résiduelles) de caractères de conformation mesurés entre milieux en situation d’hétéroscédasticité. Des tests d’homogénéité de certains paramètres (corrélations génétiques entre milieux constantes ou égales à 1, corrélations génétiques égales à 1 et corrélations intra-classes constantes, homogénéité des variances-covariances génétiques et résiduelles) intéressant les généticiens sont également présentés. Ces hypothèses sont décrites par un modèle père, unidimensionnel hétéroscédastique prenant en compte les interactions génotype x milieu. Un algorithme itératif d’espérance-maximisation (EM) est proposé pour calculer les estimées du maximum de vraisemblance restreinte (REML) des composantes résiduelles et génétiques de variance-covariance. Un test de rapport des vraisemblances restreintes est présenté pour tester les différentes hypothèses considérées. Les procédures développées sont utilisées pour l’analyse des notes de pointage de quelques caractères de morphologie de 24 301 performances d’animaux de race Montbéliarde issus de 528 pères. Sur l’ensemble des variables analysées, différentes sources (stade de lactation, pointeurs, type de logement) d’hétérogénéité des variances génétiques et résiduelles ont été mises en évidence mais en général L’héritabilité du caractère reste constante d’un milieu à l’autre.

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hal-02684128 , version 1 (01-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02684128 , version 1
  • PRODINRA : 130519

Citer

Christèle Robert-Granié, Vincent Ducrocq, Jean Louis J. L. Foulley. Hétérogénéité des variances de caractère d'animaux de race Montbéliarde. Genetics Selection Evolution, 1997, 29 (6), pp.545-570. ⟨hal-02684128⟩
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