Analyse de la connexion en population bovine Holstein française - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Genetics Selection Evolution Année : 1999

Connectedness in the French Holstein cattle population

Analyse de la connexion en population bovine Holstein française

Résumé

An analysis of connectedness in the French Holstein cattle population was carried out. This study was motivated by the fact that artificial insemination (AI) bulls are evaluated at the national level, whereas they are usually progeny tested only in the region of their AI stud. Connectedness among AI studs was measured by the generalised coefficient of determination (CD) of contrasts between mean breeding values of bulls from the different AI studs. Four connectedness components were distinguished. The relative influence of each component was assessed through the increase in prediction error variance (PEV) of the contrasts after this information was discarded. CDs of contrasts were always higher than 0.80. Therefore, connectedness level among AI studs was high and provided an accurate national genetic evaluation. Out of the different components of connectedness, withdrawing of proven bull connection data caused the greatest increase in PEV (+47.5 %) primarily due to the change in the connecting structure of the data. Genetic relationships among bulls were the next important source of information. In contrast, contributions from the planned use of the bulls progeny tested were quantitatively limited (8 % increase in PEV) and foreign semen had a minor contribution (2 % increase in PEV). However, in spite of its limited quantitative impact compared to the other components, planned sampling bull connectedness is recommended because it provides high quality data for model validation and bias investigations.
Cet article présente une analyse de la connexion du dispositif d’évaluation génétique chez les bovins laitiers Holstein en France. Cette étude est motivée par le fait que les taureaux d’insémination artificielle (IA) sont évalués au niveau national alors qu’ils ne sont généralement testés sur descendance que dans une seule région, la zone d’influence du centre d’IA propriétaire. La connexion entre centres est mesurée par le coefficient de détermination généralisé (CD) des contrastes entre moyennes de valeur génétique des taureaux des différents centres. Quatre sources de connexion sont identifiées et l’influence relative de chaque composante est mesurée par l’augmentation de variance d’erreur de prédiction (PEV) des contrastes lorsque cette composante est supprimée. Les CD des contrastes sont supérieurs à 0,80. La connexion entre centres est donc élevée et garantit une évaluation génétique précise à l’échelle nationale. Parmi les différentes composantes, la connexion par les taureaux de service est la plus importante, l’exclusion de ces données provoquant une augmentation de la PEV de 47,5 %, essentiellement due au changement de structure du dispositif. Les parentés entre taureaux de testage constituent la seconde source de connexion. La contribution de la connexion planifiée de testage est plus limitée (8 % d’augmentation de PEV) tandis que la contribution des taureaux étrangers est mineure (2 % d’augmentation de PEV). En dépit de son importance quantitative limitée, la connexion planifiée de testage destinée à améliorer les connexions est encouragée, car elle fournit un échantillon de qualité pour vérifier que l’évaluation génétique nationale n’est pas biaisée.

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Dates et versions

hal-02697272 , version 1 (01-06-2020)

Identifiants

  • HAL Id : hal-02697272 , version 1
  • PRODINRA : 136461

Citer

Eric Hanocq, Didier Boichard. Analyse de la connexion en population bovine Holstein française. Genetics Selection Evolution, 1999, 31 (2), pp.163-176. ⟨hal-02697272⟩
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