La variabilité de l’ADN mitochondrial a été étudiée chez l’abeille ouest européenne (lignée évolutive M) à partir de 973 colonies représentant 23 populations, grâce à l’analyse des profils de restriction des produits de PCR de la région intergénique COI-COII. Cette étude confirme que l’haplotype M est caractéristique de cette lignée, même si certaines populations sont lourdement introgressées par des haplotypes des deux autres lignées évolutives (A et C). Les populations de la péninsule ibérique (Apis mellifera iberica) sont caractérisées par un cline de fréquence des haplotypes A et M, le premier étant virtuellement fixé en Espagne du sud et au Portugal, le second à peu près pur dans le nord de la péninsule. Cette introgression est attribuée à des activités humaines passées. Les populations françaises (A. m. mellifera) montrent divers degrés d’introgression par des haplotypes C. Cette introgression reste très modérée dans les régions d’apiculture traditionnelle mais atteint de très forts pourcentages dans les zones où les apiculteurs professionnels importent massivement et régulièrement des reines étrangères appartenant principalement aux races A. m. ligustica et A, m. caucasica. Un arbre phylogénétique des populations, fondé sur les seuls haplotypes M, fait apparaître un groupe correspondant aux populations du nord de la France et un autre regroupant les autres populations, englobant celles de Suède et du nord-est de l’Espagne.