ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Access content directly
Conference Papers Year : 2019

ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H

Abstract

La résonance magnétique nucléaire du proton (1H-RMN) est une technologie haut-débit permettant d'obtenir des profils métaboliques, sous forme de spectres, à un coût relativement faible. C'est un outil prometteur pour détecter des biomarqueurs facilement mesurables. Cependant, les métabolites présents dans un mélange complexe ne sont pas identifiables et quantifiables directement, ce qui limite l'interprétabilité de ces approches. Pour faciliter l'utilisation de ces données, nous avons développé une méthode d'analyse automatique, encapsulée dans un nouveau package R/Bioconductor, ASICS, qui permet l'identification et la quantification globale et automatique des métabolites dans un spectre RMN. Le package permet d'enchaîner facilement toutes les étapes de l'analyse (pré-traitements, quantification, outils de diagnostic pour juger de la qualité des quantifications, analyses statistiques post-quantification).
Fichier principal
Vignette du fichier
abstractJDS2019_1.pdf (194.36 Ko) Télécharger le fichier
Origin : Publisher files allowed on an open archive
Loading...

Dates and versions

hal-02737497 , version 1 (02-06-2020)

Identifiers

  • HAL Id : hal-02737497 , version 1
  • PRODINRA : 468227

Cite

Gaëlle Lefort, Laurence Liaubet, Cécile Canlet, Nathalie Vialaneix, Rémi Servien. ASICS : identifier et quantifier des métabolites à partir d'un spectre RMN 1H. 51. Journées de Statistique de la SFdS, Société Française de Statistique (SFdS). FRA., Jun 2019, Nancy, France. ⟨hal-02737497⟩
47 View
231 Download

Share

Gmail Facebook X LinkedIn More