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Poster communications

Diversité et structuration des populations de Pseudomonas syringae en vergers d'abricotier

Résumé : Le groupe des Pseudomonas syringae est très divers, au niveau phénotypique, génétique et de ses habitats. Récemment, 13 phylogroupes et 23 clades qui prennent en compte la diversité génétique et celle des habitats de cette bactérie ubiquiste ont été décrits (Berge et al., 2014). Des outils moléculaires permettant d’identifier les P. syringae et leur phylogroupes ont été développés au laboratoire (Borschinger et al., soumis), et nous permettent de travailler sur de relativement grands effectifs d’isolats bactériens. Avec ces outils, en réalisant nous-même des prélèvements dans des vergers ciblés en 2014 et 2015, et en collaboration avec le CTIFL qui a réalisé deux importantes prospections en 2011-2012, nous avons exploré la diversité des P. syringae rencontrés dans 36 vergers d’abricotiers de la vallée du Rhône, où le chancre bactérien était présent, et ce dans différents compartiments : le sol, le couvre-sol, les débris de culture, la plante (greffon) à différents stades de son développement, les racines (porte-greffe), la plante avec ou sans symptômes déclarées. Les résultats obtenus montrent que, parmi les 2436 isolats collectés, les isolats potentiellement pathogènes proviennent de 4 phylogroupes différents qui montrent une grande diversité; par ailleurs, certains phylogroupes sont ubiquistes et d’autres spécialisés. Le sol, le couvre-sol, les débris de culture, la plante (avec ou sans symptômes visibles) sont des réservoirs potentiels de la maladie. Les conséquences en termes d’étiologie et détection du chancre bactérien de l’abricotier sont discutées.
Document type :
Poster communications
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https://hal.inrae.fr/hal-02743174
Contributor : Migration Prodinra <>
Submitted on : Wednesday, June 3, 2020 - 5:29:38 AM
Last modification on : Friday, February 5, 2021 - 4:10:03 AM
Long-term archiving on: : Thursday, December 3, 2020 - 2:01:56 AM

File

2016_Parisi_Aussois_2.pdf
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Identifiers

  • HAL Id : hal-02743174, version 1
  • PRODINRA : 343091

Citation

Luciana Parisi, Benedicte Morgaint, Benoit Borschinger, Caroline Guilbaud, Charlotte Chandeysson, et al.. Diversité et structuration des populations de Pseudomonas syringae en vergers d'abricotier. 12. Rencontres Plantes-Bactéries, Jan 2016, Aussois, France. 2016, 12ièmes Rencontres Plantes-Bactéries, 11-15 janvier 2016, Centre Paul Langevin 75300 Aussois. ⟨hal-02743174⟩

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