Implementation of a national genomic select ion in Charolais, Limousin and Blonde d’Aquitaine French beef cattle breeds
Mise en place d’évaluations génomiques nationales dans les populations bovines allaitantes françaises Charolaise, Limousine et Blonde d’Aquitaine
Résumé
Genomic evaluations have been recently implemented in Charolais (CHA), Limousin (LIM) and Blonde d’Aquitaine (BLA) beef breeds in France for five direct and two maternal traits routinely recorded at birth and weaning. Genomic estimated breeding values (GEBV) are calculated via a two steps method. First, the direct genomic breeding values (DGV) of the genotyped animals are estimated using Bayes-C methodology, considering a reference population (RP) constituted by 1,029 to 5,181 animals in CHA, 606 to 3,995 animals in LIM, and 1645 to 4282 animals in BLA populations, depending on the considered trait. The DGV of each animal is then blended with its national pedigree-based EBV (pEBV). To date, the gains in reliability compared to pEBV are moderate (+3% to +23% for a candidate with only parental information, in CHA breed), but they will increase as the RP size will grow. Carcass traits will be included in genomic evaluations in 2015 for the three populations. Genomic evaluations for new breeds and traits will be implemented when sufficient RP will be available.
Une évaluation génomique nationale a été mise en place en 2015 dans les races Charolaise (CHA), Limousine (LIM) et Blonde d’Aquitaine (BLA) pour les caractères mesurés en ferme à la naissance et au sevrage. Les index génomiques (GEBV) sont calculés en combinant la valeur génomique directe (DGV) de chaque individu génotypé à son index polygénique IBOVAL, afin de tirer profit des performances des apparentés non génotypés. Les DGV sont estimées par la méthodologie du Bayes-C, grâce à une population de référence (PR) constituée de 1029 à 5181 individus en CHA, de 606 à 3995 individus en LIM et de 1645 à 4282 individus en BLA, selon le caractère. Le gain de précision par rapport aux index polygéniques est actuellement modeste (+3% à +23% pour un candidat uniquement connu sur ascendance en CHA), mais augmentera avec la taille des PR. Des évaluations génomiques pour les caractères de carcasse seront mises en place sur le même modèle fin 2015 dans les 3 races.
Domaines
Sciences du Vivant [q-bio]
Origine : Fichiers produits par l'(les) auteur(s)