Ancient hybridizations among the ancestral genomes of bread wheat - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Accéder directement au contenu
Article Dans Une Revue Science Année : 2014

Ancient hybridizations among the ancestral genomes of bread wheat

T. Marcussen (1) , S. Sandve (1) , L. Heier (2) , M. Spannagl (3, 2) , M. Pfeifer (2, 3) , K. Jakobsen , B. Wulff (4) , B. Steuernagel (4) , K. Mayer (3, 2) , O.-A. Olsen , J. Rogers , J. Dole el , C. Pozniak , K. Eversole (5) , C. Feuillet (6) , B. Gill , B. Friebe , A. Lukaszewski , Pierre Sourdille (7) , T. Endo , M. Kubalakova (8) , J.  ihalikova , Z. Dubska , J. Vrana (8) , R.  perkova , H.  imkova , M. Febrer , L. Clissold , K. Mclay , K. Singh (9) , P. Chhuneja , N. Singh , J. Khurana , E. Akhunov , F. Choulet (10, 7) , A. Alberti (11) , Valérie Barbe (12) , P. Wincker (13) , H. Kanamori (14) , F. Kobayashi , T. Itoh , T. Matsumoto (15) , H. Sakai (16) , T. Tanaka (17) , J. Wu (18) , Y. Ogihara , H. Handa , P. Maclachlan , A. Sharpe , D. Klassen , D. Edwards , J. Batley (19) , S. Lien (1) , M. Caccamo , S. Ayling , R. Ramirez-Gonzalez , B. Clavijo , J. Wright (20) , M. Martis , M. Mascher , J. Chapman , J. Poland , U. Scholz , K. Barry , R. Waugh , D. Rokhsar , G. Muehlbauer , N. Stein (21) , H. Gundlach , M. Zytnicki , Véronique Jamilloux (22) , H. Quesneville (22) , T. Wicker (23) , P. Faccioli , M. Colaiacovo , A. Stanca , H. Budak , L. Cattivelli (24) , N. Glover (7) , L. Pingault (7) , E. Paux (7) , S. Sharma (25) , R. Appels (26) , M. M. Bellgard (27) , B. Chapman (28) , T. Nussbaumer (29) , K. Bader , H. Rimbert (30) , S. Wang , R. Knox , A. Kilian (31) , M. Alaux , F. Alfama , L. Couderc , N. Guilhot (7) , C. Viseux , M. Loaec , B. Keller (32) , S. Praud (33)
K. Jakobsen
  • Fonction : Auteur
O.-A. Olsen
  • Fonction : Auteur
J. Rogers
  • Fonction : Auteur
J. Dole el
  • Fonction : Auteur
C. Pozniak
  • Fonction : Auteur
K. Eversole
  • Fonction : Auteur
C. Feuillet
  • Fonction : Auteur
B. Gill
  • Fonction : Auteur
B. Friebe
  • Fonction : Auteur
A. Lukaszewski
  • Fonction : Auteur
T. Endo
  • Fonction : Auteur
J.  ihalikova
  • Fonction : Auteur
Z. Dubska
  • Fonction : Auteur
R.  perkova
  • Fonction : Auteur
H.  imkova
  • Fonction : Auteur
M. Febrer
  • Fonction : Auteur
L. Clissold
  • Fonction : Auteur
K. Mclay
  • Fonction : Auteur
P. Chhuneja
  • Fonction : Auteur
N. Singh
  • Fonction : Auteur
J. Khurana
  • Fonction : Auteur
E. Akhunov
  • Fonction : Auteur
Valérie Barbe
F. Kobayashi
  • Fonction : Auteur
T. Itoh
  • Fonction : Auteur
T. Tanaka
Y. Ogihara
  • Fonction : Auteur
H. Handa
  • Fonction : Auteur
P. Maclachlan
  • Fonction : Auteur
A. Sharpe
  • Fonction : Auteur
D. Klassen
  • Fonction : Auteur
D. Edwards
  • Fonction : Auteur
M. Caccamo
  • Fonction : Auteur
S. Ayling
  • Fonction : Auteur
R. Ramirez-Gonzalez
  • Fonction : Auteur
B. Clavijo
  • Fonction : Auteur
J. Wright
  • Fonction : Auteur
-
M. Martis
  • Fonction : Auteur
M. Mascher
  • Fonction : Auteur
J. Chapman
  • Fonction : Auteur
J. Poland
  • Fonction : Auteur
U. Scholz
  • Fonction : Auteur
K. Barry
  • Fonction : Auteur
R. Waugh
  • Fonction : Auteur
D. Rokhsar
  • Fonction : Auteur
G. Muehlbauer
  • Fonction : Auteur
H. Gundlach
  • Fonction : Auteur
M. Zytnicki
  • Fonction : Auteur
P. Faccioli
  • Fonction : Auteur
M. Colaiacovo
  • Fonction : Auteur
A. Stanca
  • Fonction : Auteur
H. Budak
  • Fonction : Auteur
R. Appels
  • Fonction : Auteur
K. Bader
  • Fonction : Auteur
H. Rimbert
S. Wang
  • Fonction : Auteur
R. Knox
  • Fonction : Auteur
M. Alaux
  • Fonction : Auteur
F. Alfama
  • Fonction : Auteur
L. Couderc
  • Fonction : Auteur
C. Viseux
  • Fonction : Auteur
M. Loaec
  • Fonction : Auteur
S. Praud
  • Fonction : Auteur

Résumé

The allohexaploid bread wheat genome consists of three closely related subgenomes (A, B, and D), but a clear understanding of their phylogenetic history has been lacking. We used genome assemblies of bread wheat and five diploid relatives to analyze genome-wide samples of gene trees, as well as to estimate evolutionary relatedness and divergence times. We show that the A and B genomes diverged from a common ancestor similar to 7 million years ago and that these genomes gave rise to the D genome through homoploid hybrid speciation 1 to 2 million years later. Our findings imply that the present-day bread wheat genome is a product of multiple rounds of hybrid speciation (homoploid and polyploid) and lay the foundation for a new framework for understanding the wheat genome as a multilevel phylogenetic mosaic.
Fichier non déposé

Dates et versions

hal-02889053 , version 1 (03-07-2020)

Identifiants

Citer

T. Marcussen, S. Sandve, L. Heier, M. Spannagl, M. Pfeifer, et al.. Ancient hybridizations among the ancestral genomes of bread wheat. Science, 2014, 345 (6194), pp.1250092-1250092. ⟨10.1126/science.1250092⟩. ⟨hal-02889053⟩
148 Consultations
0 Téléchargements

Altmetric

Partager

Gmail Mastodon Facebook X LinkedIn More