Global transpiration data from sap flow measurements: the SAPFLUXNET database - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement
Article Dans Une Revue (Data Paper) Earth System Science Data Année : 2021

Global transpiration data from sap flow measurements: the SAPFLUXNET database

Rafael Poyatos (1, 2) , Víctor Granda (1, 3) , Víctor Flo (1) , Mark A Adams (4, 5) , Balázs Adorján (6) , David Aguadé (1) , Marcos P M Aidar , Scott Allen , M Susana Alvarado-Barrientos , Kristina J Anderson-Teixeira , Luiza Maria Aparecido , M Altaf Arain , Ismael Aranda , Heidi Asbjornsen , Robert Baxter , Eric Beamesderfer , Z Carter Berry , Daniel Berveiller , Bethany Blakely , Johnny Boggs , Gil Bohrer , Paul V Bolstad , Damien Bonal (7) , Rosvel Bracho , Patricia Brito , Jason Brodeur , Fernando Casanoves , Jérôme Chave (8) , Hui Chen , Cesar Cisneros , Kenneth Clark , Edoardo Cremonese , Hongzhong Dang , Jorge S David , Teresa S David , Nicolas Delpierre (9) , Ankur R Desai , Frederic C Do (10) , Michal Dohnal , Jean-Christophe Domec , Sebinasi Dzikiti , Colin Edgar , Rebekka Eichstaedt , Tarek S El-Madany , Jan Elbers , Cleiton B Eller , Eugénie S Euskirchen , Brent Ewers , Patrick Fonti , Alicia Forner , David I Forrester , Helber C Freitas , Marta Galvagno , Omar Garcia-Tejera , Chandra Prasad Ghimire , Teresa E Gimeno , John Grace , André Granier (7) , Anne Griebel , Yan Guangyu , Mark B Gush , Paul J Hanson , Niles J Hasselquist , Ingo Heinrich , Virginia Hernandez-Santana , Valentine Herrmann , Teemu Hölttä , Friso Holwerda , James Irvine , Supat Isarangkool Na Ayutthaya , Paul G Jarvis , Hubert Jochheim , Carlos A Joly , Julia Kaplick , Hyun Seok Kim , Leif Klemedtsson , Heather Kropp , Fredrik Lagergren , Patrick Lane , Petra Lang , Andrei Lapenas , Víctor Lechuga , Minsu Lee , Christoph Leuschner , Jean-Marc Limousin (11) , Juan Carlos Linares , Maj-Lena Linderson , Anders Lindroth , Pilar Llorens , Álvaro López-Bernal , Michael M Loranty , Dietmar Lüttschwager , Cate Macinnis-Ng , Isabelle Maréchaux (12) , Timothy A Martin , Ashley Matheny , Nate Mcdowell , Sean Mcmahon , Patrick Meir , Ilona Mészáros , Mirco Migliavacca , Patrick Mitchell , Meelis Mölder , Leonardo Montagnani , Georgianne W Moore , Ryogo Nakada , Furong Niu , Rachael H Nolan , Richard Norby , Kimberly Novick , Walter Oberhuber , Nikolaus Obojes , A Christopher Oishi , Rafael S Oliveira , Ram Oren , Jean-Marc Ourcival (11) , Teemu Paljakka , Oscar Perez-Priego , Pablo L Peri , Richard L Peters , Sebastian Pfautsch , William T Pockman , Yakir Preisler , Katherine Rascher , George Robinson , Humberto Rocha , Alain Rocheteau (10) , Alexander Röll , Bruno H P Rosado , Lucy Rowland , Alexey V Rubtsov , Santiago Sabaté , Yann Salmon , Roberto L Salomón , Elisenda Sánchez-Costa , Karina V R Schäfer , Bernhard Schuldt , Alexandr Shashkin , Clément Stahl , Marko Stojanović , Juan Carlos Suárez , Ge Sun , Justyna Szatniewska , Fyodor Tatarinov , Frank M Thomas , Pantana Tor-Ngern , Josef Urban , Fernando Valladares , Christiaan van Der Tol , Ilja van Meerveld , Andrej Varlagin , Holm Voigt , Jeffrey Warren , Christiane Werner , Willy Werner , Gerhard Wieser , Lisa Wingate , Stan Wullschleger , Koong Yi , Roman Zweifel , Kathy Steppe , Maurizio Mencuccini , Jordi Martínez-Vilalta
Marcos P M Aidar
  • Fonction : Auteur
Scott Allen
  • Fonction : Auteur
M Susana Alvarado-Barrientos
  • Fonction : Auteur
Kristina J Anderson-Teixeira
  • Fonction : Auteur
Luiza Maria Aparecido
  • Fonction : Auteur
M Altaf Arain
  • Fonction : Auteur
Ismael Aranda
Heidi Asbjornsen
  • Fonction : Auteur
Robert Baxter
  • Fonction : Auteur
Eric Beamesderfer
  • Fonction : Auteur
Z Carter Berry
  • Fonction : Auteur
Daniel Berveiller
Bethany Blakely
  • Fonction : Auteur
Johnny Boggs
Gil Bohrer
  • Fonction : Auteur
Paul V Bolstad
  • Fonction : Auteur
Damien Bonal
Rosvel Bracho
  • Fonction : Auteur
Patricia Brito
  • Fonction : Auteur
Jason Brodeur
  • Fonction : Auteur
Fernando Casanoves
  • Fonction : Auteur
Hui Chen
Cesar Cisneros
  • Fonction : Auteur
Kenneth Clark
  • Fonction : Auteur
Edoardo Cremonese
Hongzhong Dang
  • Fonction : Auteur
Jorge S David
  • Fonction : Auteur
Teresa S David
  • Fonction : Auteur
Nicolas Delpierre
Ankur R Desai
  • Fonction : Auteur
Michal Dohnal
  • Fonction : Auteur
Jean-Christophe Domec
  • Fonction : Auteur
Sebinasi Dzikiti
  • Fonction : Auteur
Colin Edgar
Rebekka Eichstaedt
  • Fonction : Auteur
Tarek S El-Madany
  • Fonction : Auteur
Jan Elbers
  • Fonction : Auteur
Cleiton B Eller
  • Fonction : Auteur
Eugénie S Euskirchen
  • Fonction : Auteur
Brent Ewers
  • Fonction : Auteur
Patrick Fonti
  • Fonction : Auteur
Alicia Forner
  • Fonction : Auteur
David I Forrester
Helber C Freitas
  • Fonction : Auteur
Marta Galvagno
  • Fonction : Auteur
Omar Garcia-Tejera
  • Fonction : Auteur
Chandra Prasad Ghimire
  • Fonction : Auteur
Teresa E Gimeno
  • Fonction : Auteur
John Grace
  • Fonction : Auteur
André Granier
  • Fonction : Auteur
Anne Griebel
  • Fonction : Auteur
Yan Guangyu
  • Fonction : Auteur
Mark B Gush
  • Fonction : Auteur
Paul J Hanson
  • Fonction : Auteur
Niles J Hasselquist
  • Fonction : Auteur
Ingo Heinrich
  • Fonction : Auteur
Virginia Hernandez-Santana
  • Fonction : Auteur
Valentine Herrmann
  • Fonction : Auteur
Teemu Hölttä
  • Fonction : Auteur
Friso Holwerda
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James Irvine
  • Fonction : Auteur
Supat Isarangkool Na Ayutthaya
  • Fonction : Auteur
Paul G Jarvis
  • Fonction : Auteur
Hubert Jochheim
  • Fonction : Auteur
Carlos A Joly
  • Fonction : Auteur
Julia Kaplick
  • Fonction : Auteur
Hyun Seok Kim
  • Fonction : Auteur
Leif Klemedtsson
  • Fonction : Auteur
Heather Kropp
  • Fonction : Auteur
Fredrik Lagergren
  • Fonction : Auteur
Patrick Lane
  • Fonction : Auteur
Petra Lang
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Andrei Lapenas
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Víctor Lechuga
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Minsu Lee
  • Fonction : Auteur
Christoph Leuschner
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Juan Carlos Linares
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Maj-Lena Linderson
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Anders Lindroth
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Pilar Llorens
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Álvaro López-Bernal
  • Fonction : Auteur
Michael M Loranty
  • Fonction : Auteur
Dietmar Lüttschwager
  • Fonction : Auteur
Cate Macinnis-Ng
Timothy A Martin
  • Fonction : Auteur
Ashley Matheny
  • Fonction : Auteur
Nate Mcdowell
Sean Mcmahon
Patrick Meir
  • Fonction : Auteur
Ilona Mészáros
  • Fonction : Auteur
Mirco Migliavacca
Patrick Mitchell
  • Fonction : Auteur
Meelis Mölder
Leonardo Montagnani
Georgianne W Moore
  • Fonction : Auteur
Ryogo Nakada
  • Fonction : Auteur
Furong Niu
  • Fonction : Auteur
Rachael H Nolan
Richard Norby
  • Fonction : Auteur
Kimberly Novick
Walter Oberhuber
  • Fonction : Auteur
Nikolaus Obojes
  • Fonction : Auteur
A Christopher Oishi
  • Fonction : Auteur
Rafael S Oliveira
  • Fonction : Auteur
Ram Oren
  • Fonction : Auteur
Teemu Paljakka
  • Fonction : Auteur
Oscar Perez-Priego
  • Fonction : Auteur
Pablo L Peri
  • Fonction : Auteur
Richard L Peters
  • Fonction : Auteur
Sebastian Pfautsch
William T Pockman
  • Fonction : Auteur
Yakir Preisler
  • Fonction : Auteur
Katherine Rascher
  • Fonction : Auteur
George Robinson
  • Fonction : Auteur
Humberto Rocha
  • Fonction : Auteur
Alexander Röll
  • Fonction : Auteur
Bruno H P Rosado
  • Fonction : Auteur
Lucy Rowland
Alexey V Rubtsov
  • Fonction : Auteur
Santiago Sabaté
  • Fonction : Auteur
Yann Salmon
  • Fonction : Auteur
Roberto L Salomón
  • Fonction : Auteur
Elisenda Sánchez-Costa
  • Fonction : Auteur
Karina V R Schäfer
  • Fonction : Auteur
Bernhard Schuldt
  • Fonction : Auteur
Alexandr Shashkin
  • Fonction : Auteur
Clément Stahl
Marko Stojanović
  • Fonction : Auteur
Juan Carlos Suárez
  • Fonction : Auteur
Ge Sun
  • Fonction : Auteur
Justyna Szatniewska
  • Fonction : Auteur
Fyodor Tatarinov
  • Fonction : Auteur
Frank M Thomas
  • Fonction : Auteur
Pantana Tor-Ngern
  • Fonction : Auteur
Josef Urban
Fernando Valladares
  • Fonction : Auteur
Christiaan van Der Tol
  • Fonction : Auteur
Ilja van Meerveld
  • Fonction : Auteur
Andrej Varlagin
Holm Voigt
  • Fonction : Auteur
Jeffrey Warren
  • Fonction : Auteur
Christiane Werner
  • Fonction : Auteur
Willy Werner
  • Fonction : Auteur
Gerhard Wieser
  • Fonction : Auteur
Lisa Wingate
  • Fonction : Auteur
Stan Wullschleger
  • Fonction : Auteur
Koong Yi
  • Fonction : Auteur
Roman Zweifel
  • Fonction : Auteur
Kathy Steppe
  • Fonction : Auteur
Maurizio Mencuccini
Jordi Martínez-Vilalta

Résumé

Plant transpiration links physiological responses of vegetation to water supply and demand with hydrological, energy, and carbon budgets at the land–atmosphere interface. However, despite being the main land evaporative flux at the global scale, transpiration and its response to environmental drivers are currently not well constrained by observations. Here we introduce the first global compilation of whole-plant transpiration data from sap flow measurements (SAPFLUXNET, https://sapfluxnet.creaf.cat/, last access: 8 June 2021). We harmonized and quality-controlled individual datasets supplied by contributors worldwide in a semi-automatic data workflow implemented in the R programming language. Datasets include sub-daily time series of sap flow and hydrometeorological drivers for one or more growing seasons, as well as metadata on the stand characteristics, plant attributes, and technical details of the measurements. SAPFLUXNET contains 202 globally distributed datasets with sap flow time series for 2714 plants, mostly trees, of 174 species. SAPFLUXNET has a broad bioclimatic coverage, with woodland/shrubland and temperate forest biomes especially well represented (80 % of the datasets). The measurements cover a wide variety of stand structural characteristics and plant sizes. The datasets encompass the period between 1995 and 2018, with 50 % of the datasets being at least 3 years long. Accompanying radiation and vapour pressure deficit data are available for most of the datasets, while on-site soil water content is available for 56 % of the datasets. Many datasets contain data for species that make up 90 % or more of the total stand basal area, allowing the estimation of stand transpiration in diverse ecological settings. SAPFLUXNET adds to existing plant trait datasets, ecosystem flux networks, and remote sensing products to help increase our understanding of plant water use, plant responses to drought, and ecohydrological processes. SAPFLUXNET version 0.1.5 is freely available from the Zenodo repository (https://doi.org/10.5281/zenodo.3971689; Poyatos et al., 2020a). The “sapfluxnetr” R package – designed to access, visualize, and process SAPFLUXNET data – is available from CRAN.
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Dates et versions

hal-03261880 , version 1 (16-06-2021)

Licence

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Citer

Rafael Poyatos, Víctor Granda, Víctor Flo, Mark A Adams, Balázs Adorján, et al.. Global transpiration data from sap flow measurements: the SAPFLUXNET database. Earth System Science Data, 2021, 13, pp.2607 - 2649. ⟨10.5194/essd-13-2607-2021⟩. ⟨hal-03261880⟩
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