Les préparations infantiles (PI) hypoallergéniques (HA) sont utilisées en prévention des allergies chez les enfants à risque. Dans la cohorte de naissance ELFE, l’alimentation lactée a été évaluée à 2 mois et l’eczéma, les sifflements et les bronchiolites à 2 mois, 1 an et 2 ans. Les allergies alimentaires ont été déclarées à 2 mois et 2 ans. Les associations entre l’alimentation lactée à 2 mois et l’incidence des allergies ont été étudiées chez plus de 8 000 enfants par régressions logistiques, avec pour catégorie de référence le lait maternel. Les enfants présentant des allergies alimentaires à 2 mois ou utilisant des PI pour enfant allergique ont été exclus des analyses. L’utilisation de PI à 2 mois était associée avec un risque accru de bronchiolites fréquentes à 1 an. L’utilisation de PI-HA à 2 mois était associée à un risque accru de bronchiolites fréquentes à 1 et 2 ans (OR=2,6 [1,6-4,5] ; OR=2,3 [1,4-3,9], respectivement), de sifflements à 1 an (OR=1,9 [1,4-2,5]) et d’allergies alimentaires à 2 ans (OR=2,1 [1,2-3,9]). L’eczéma déclaré à 1 ou 2 ans et l’asthme déclaré à 2 ans n’étaient pas associés à l’alimentation lactée à 2 mois. Les PI-HA ne semblent pas prévenir des allergies jusqu’à 2 ans, même après prise en compte du risque familial d’allergie.