Development of a potato core collection
Développement d'une core collection pomme de terre
Résumé
Developing a core collection consists in selecting, in a more or less large collection, a small panel of genotypes representing the genetic diversity available in the initial collection, with minimum redundancy. This study presents the development of a core collection of 48 genotypes representative of the genetic diversity of a panel of 350 tetraploid varieties of potato (Solanum tuberosum L.). It was built using microsatellite marker genotyping data (SSR) and M strategy which maximizes allelic diversity. This core collection forms a panel of major interest that has been exploited up till now in the framework of two research projects: on the one hand to assess the possibility of exploiting the SNP SolCAP array to characterize the genetic resources maintained in BRC BrACySol, and on the other hand, to assess the structural and morphological variability of potato starch grains.
Le développement d’une core collection consiste à sélectionner, au sein d’une collection ayant un effectif plus ou moins important, un petit panel de génotypes qui représente la diversité génétique disponible dans la collection de départ, avec un minimum de redondance. Cette étude présente le développement d’une core collection de 48 génotypes, représentative de la diversité génétique d’un panel de 350 variétés tétraploïdes de pomme de terre (Solanum tuberosum L.). Elle a été établie en utilisant des données de génotypage par marqueurs microsatellites (SSR) et la stratégie M qui maximise la diversité allélique. Cette core collection constitue un panel d’un grand intérêt qui a été exploité jusqu’à présent dans le cadre de deux projets de recherche : d’une part, pour évaluer la possibilité d’exploiter la puce SNP SolCAP pour caractériser les ressources génétiques maintenues au sein du CRB BrACySol, et, d’autre part, pour évaluer la variabilité structurale et morphologique des grains d’amidon de pomme de terre
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