Détermination des volumes cellulaires et subcellulaires par analyse d’images de microscopie : Comment estimer la vitesse de croissance de cellules du fruit ? - INRAE - Institut national de recherche pour l’agriculture, l’alimentation et l’environnement Access content directly
Journal Articles NOV'AE Year : 2023

Determining cellular and subcellular volumes by analyzing microscope images: How can the speed of fruit cell growth be estimated?

Détermination des volumes cellulaires et subcellulaires par analyse d’images de microscopie : Comment estimer la vitesse de croissance de cellules du fruit ?

Abstract

The estimation of cell volumes and subcellular proportions is necessary for studying metabolic fluxes in fruit during its development. By analyzing optical microscopy images using the freeware "Image J", we were able to collect the data needed to parameterize a fruit cell model described as ellipsoidal in shape. The volume estimates obtained for different stages of fruit development enabled us to obtain growth kinetics for the average cell and its major compartments. By fitting the measured data to an appropriate mathematical function, we were able to calculate cell growth rate over time.
L’estimation des volumes cellulaires et des proportions subcellulaires est nécessaire pour l’étude des flux métaboliques dans le fruit au cours du développement. L’analyse d’images de microscopie optique avec le logiciel libre « Image J » nous a permis de collecter les grandeurs utiles au paramétrage du modèle de cellule de fruit décrit comme étant de forme ellipsoïdale. Les estimations de volumes obtenues pour différents stades de développement du fruit ont permis d’obtenir une cinétique de croissance de la cellule moyenne ainsi que de ses compartiments majeurs. L’ajustement des données mesurées à une fonction mathématique adaptée a permis de calculer la vitesse de croissance cellulaire au cours du temps.
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hal-04575735 , version 1 (15-05-2024)

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  • HAL Id : hal-04575735 , version 1

Cite

Marie-Hélène Andrieu, Catherine Cheniclet, Martine Dieuaide-Noubhani, Bertrand Beauvoit, Yves Gibon. Détermination des volumes cellulaires et subcellulaires par analyse d’images de microscopie : Comment estimer la vitesse de croissance de cellules du fruit ?. NOV'AE, 2023, 14. ⟨hal-04575735⟩
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