Les vergers fruitiers sont confrontés à l’attaque de multiples bioagresseurs qui sont responsables d’importants dégâts. Malgré la demande urgente de réduction des produits phytosanitaires, les pesticides demeurent le moyen de lutte le plus efficace. Une solution prometteuse pour répondre à cette demande repose sur l’utilisation de la diversité génétique naturelle pour créer des variétés dites ‘résilientes’, c’est-à-dire peu affectées par des perturbations extérieures ou qui retrouvent rapidement leur état de production initial après l’exposition à des stress combinés. Cette étude vise à définir et à caractériser les composantes phénotypiques et génétiques de la résilience chez les Prunus. Pour ce faire, nous avons déployé et maintenu en conditions phytosanitaires réduites deux core-collections de respectivement 150 et 206 accessions d’abricotier et de pêcher dans cinq lieux différents. À travers un suivi fin et intégratif des multiples symptômes de bioagresseurs au fil des années, nous avons décrypté les différentes manifestations phénotypiques de la résilience. Différents modèles de génétique d'associations ont été testés afin d'identifier les marqueurs génétiques liés aux composantes de la résilience. Cette étude représente une première étape indispensable de compréhension des mécanismes de résilience et contribue à une modification profonde et nécessaire des objectifs de création variétale pour tendre vers des systèmes agricoles résilients.