Poster De Conférence Année : 2023

Dynamique chromatidienne associée à la tolérance/sensibilité à la dessiccation pendant la germination des graines

Résumé

Les graines sèches matures possèdent un mécanisme particulier qui leur permet de survivre à une perte de plus de 90 % de leur contenu en eau, appelé tolérance à la dessiccation (DT). La DT de la graine est étroitement régulée, elle est acquise pendant le développement de la graine et perdue peu de temps après la germination. Le moment de la perte de la DT après la germination peut être prolongé par des stimuli exogènes, par exemple un léger stress osmotique permet une ré-induction de la DT chez les graines germées. Les processus moléculaires impliqués dans l'acquisition/perte et la réinduction de la DT ont été bien étudiés au niveau transcriptomique, ce qui a permis d'identifier des réseaux de gènes associés à la DT. Cependant, notre compréhension des mécanismes moléculaires qui activent/désactivent les réseaux génétiques de la DT restent fragmentaires, en particulier en ce qui concerne les aspects épigénétiques. Ici, nous avons identifié les gènes DT-core (un groupe de gènes spécifiquement associés à la réinduction de DT) dans les tissus racinaires de Medicago germés par RNA-Seq. Puis, nous avons déterminé l'état chromatidien des loci de ces gènes DT-core par ATAC-Seq pour révéler que l'état de la chromatine des régions génomiques contenant les gènes DT-core étaient clairement lié à leurs niveaux d'expression; une chromatine plus ouverte avec des expressions génétiques plus élevées dans les tissus tolérants à la dessiccation stimulés par un léger stress osmotique, à l'inverse une chromatine plus fermée avec des expressions plus faibles dans les tissus sensibles à la dessiccation, en particulier à un stade avancé de la post-germination. En outre, l’analyse des marques répressives histones par ChIP-Seq nous a permis de détecter la presence de H3K27me3 sur les séquences des gènes DT-core à un stade avancé de germination, ce qui suggère que le silencing des gènes DT dans les programmes de développement post-germination serait principalement dû aux marques H3K27me3 et par l'action du complexe PRC2.

Fichier non déposé

Dates et versions

hal-04665357 , version 1 (31-07-2024)

Identifiants

  • HAL Id : hal-04665357 , version 1

Citer

Naoto Sano, Jaiana Malabarba, Zhijuan Chen, Sylvain Gaillard, David Windels, et al.. Dynamique chromatidienne associée à la tolérance/sensibilité à la dessiccation pendant la germination des graines. Graines 2023, Nov 2023, Versailles, France. ⟨hal-04665357⟩
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